[发明专利]一种大菱鲆个体育种值评估方法

摘要

本发明的目的是提供一种大菱鲆个体育种值评估方法，以解决利用背景来源不明、物理系谱残缺、或者利用引进的大菱鲆群体进行良种选育时，无法利用物理系谱信息推算出个体亲缘系数，从而不能进行个体遗传参数评估的问题，从而弥补现有技术的不足。相比于依靠物理系谱评估育种值的方法，本方法的方法能够大幅节约个体育种值评估的时间期限，即无需经过多代培育家系材料等繁琐步骤，只需一代即可完成个体育种值评估。

主权项

一种大菱鲆个体育种值评估方法，其特征在于，所述的方法包括有如下的步骤：1)首先将待检测的大菱鲆雌雄个体来构建家系，2)对构建的家系中的子代个体在养殖后，选取全部或部分个体进行生长性状的测量；获得个体的生长性状的测量值；3)提取构建家系的雌雄亲本的DNA进行SSR位点基因分型；记录每一个体在每个SSR位点上的等位基因峰值数据；4)利用Coancestry1.0.1.2软件对SSR分型数据进行计算求得亲本个体间的共祖率coancestry及近交系数F；家系子代个体间的共祖率由其父母本间的共祖率根据公式(1)求得，其中个体与其本身的共祖率由公式(2)求出，并按公式(3)计算出子代个体间的遗传相关系数，即分子遗传相关系数；${\mathrm{\θ}}_{\mathrm{PQ}}=\frac{1}{4}({\mathrm{\θ}}_{\mathrm{AC}}+{\mathrm{\θ}}_{\mathrm{AD}}+{\mathrm{\θ}}_{\mathrm{BC}}+{\mathrm{\θ}}_{\mathrm{BD}})---\left(1\right)$${\mathrm{\θ}}_{\mathrm{AA}}=\frac{1}{2}(1+F_A)---\left(2\right)$r_PQ＝2θ_PQ    (3)其中A和B、C和D分别代表P和Q的父母本，θ代表共祖率，F代表近交系数，r代表遗传相关系数；5)然后利用R3.0.2软件将父母本间共祖率转化为其子代个体间的分子遗传相关系数矩阵；最后利用ASReml软件计算个体育种值：y＝Xb+Zu+e其中y代表大菱鲆家系子代个体的测量值，bi代表固定效应，u代表随机效应，e表示残差效应；再根据狭义遗传力公式求得遗传力估计值：$h^2={\mathrm{\σ}}_a^2/{\mathrm{\σ}}_p^2$和分别表示加性遗传方差及表现方差。