[发明专利]一种高通量环状RNA测序的方法有效
申请号: | 201410604748.2 | 申请日: | 2014-10-31 |
公开(公告)号: | CN104388548A | 公开(公告)日: | 2015-03-04 |
发明(设计)人: | 周俊飞;高利芬;陈利红;李丽丽;彭海;张继;方治伟 | 申请(专利权)人: | 江汉大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京三高永信知识产权代理有限责任公司 11138 | 代理人: | 徐立 |
地址: | 430056 湖北省武汉市*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明公开了一种高通量环状RNA测序的方法,属于分子生物学领域。该方法包括:人工合成外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA;对外源环状ERCC-0013-RNA进行质量控制;将外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA按等摩尔比混合,得到混合外源RNA;向待测序样本的总RNA中加入混合外源RNA,得到第一混合物;去除第一混合物中的核糖体RNA,得到第二混合物;对第二混合物进行3’末端生物素标记,并去除标记上生物素的套索RNA及线性RNA,得到第三混合物;去除第三混合物中的线性RNA,得到第四混合物;对第四混合物进行标准的高通量转录组测序并对测序数据进行生物学分析。本发明能够准确反映出生物体内的基因在特定条件下的表达情况,降低了的成本。 | ||
搜索关键词: | 一种 通量 环状 rna 方法 | ||
【主权项】:
一种高通量环状RNA测序的方法,其特征在于,所述方法包括:人工合成外源线性ERCC‑0004‑RNA和外源环状ERCC‑0013‑RNA;对所述外源环状ERCC‑0013‑RNA进行质量控制;将所述外源线性ERCC‑0004‑RNA和所述外源环状ERCC‑0013‑RNA按等摩尔比混合,得到混合外源RNA;向待测序样本的总RNA中加入所述混合外源RNA,所述总RNA与所述混合外源RNA的质量比为2000:1,得到第一混合物;去除所述第一混合物中的核糖体RNA,得到第二混合物;对所述第二混合物进行3’末端生物素标记,并去除被标记上生物素的套索RNA及线性RNA,所述线性RNA包括所述总RNA中的内源线性RNA和所述外源线性ERCC‑0004‑RNA,得到第三混合物;去除所述第三混合物中残留的所述线性RNA,得到第四混合物;对所述第四混合物进行高通量转录组测序并对测序数据进行生物学分析。
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