[发明专利]二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法在审
申请号: | 201410606732.5 | 申请日: | 2014-10-30 |
公开(公告)号: | CN104357563A | 公开(公告)日: | 2015-02-18 |
发明(设计)人: | 涂景;陆祖宏;高珅;郭靖;段梦沁;乔祎 | 申请(专利权)人: | 东南大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 柏尚春 |
地址: | 214000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法,分两次对基因组DNA进行片段化后测序以获得单倍型信息:第一次DNA片段化将基因组DNA分割成为一系列较长的核酸片段,在较长的核酸片段中构建一组片段文库,对每个片段文库进行扩增;将扩增后的较长的核酸片段进行第二次DNA片段化,第二次DNA片段化后得到较短的核酸片段,每个片段文库独立构建测序文库并分别进行高通量测序,测序的结果首先在每个片段文库内部进行序列比对或拼接,获得较长的核酸序列后进行跨片段文库的序列比对和拼接,从而实现利用高通量测序获得基因组单倍型信息。本发明方法实现了利用高通量测序获得基因组单倍型信息,且简单、效率高。 | ||
搜索关键词: | 二次 dna 片段 基因组 单倍型高 通量 方法 | ||
【主权项】:
二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法,其特征在于:分两次对基因组DNA进行片段化后测序以获得单倍型信息:第一次DNA片段化将基因组DNA分割成为一系列较长的核酸片段,在较长的核酸片段中构建一组片段文库,对每个片段文库进行扩增;将扩增后的较长的核酸片段进行第二次DNA片段化,第二次DNA片段化后得到较短的核酸片段,每个片段文库独立构建测序文库并分别进行高通量测序,测序的结果首先在每个片段文库内部进行序列比对或拼接,获得较长的核酸序列后进行跨片段文库的序列比对和拼接,从而实现利用高通量测序获得基因组单倍型信息。
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