[发明专利]二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法在审

专利信息
申请号: 201410606732.5 申请日: 2014-10-30
公开(公告)号: CN104357563A 公开(公告)日: 2015-02-18
发明(设计)人: 涂景;陆祖宏;高珅;郭靖;段梦沁;乔祎 申请(专利权)人: 东南大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 柏尚春
地址: 214000 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法,分两次对基因组DNA进行片段化后测序以获得单倍型信息:第一次DNA片段化将基因组DNA分割成为一系列较长的核酸片段,在较长的核酸片段中构建一组片段文库,对每个片段文库进行扩增;将扩增后的较长的核酸片段进行第二次DNA片段化,第二次DNA片段化后得到较短的核酸片段,每个片段文库独立构建测序文库并分别进行高通量测序,测序的结果首先在每个片段文库内部进行序列比对或拼接,获得较长的核酸序列后进行跨片段文库的序列比对和拼接,从而实现利用高通量测序获得基因组单倍型信息。本发明方法实现了利用高通量测序获得基因组单倍型信息,且简单、效率高。
搜索关键词: 二次 dna 片段 基因组 单倍型高 通量 方法
【主权项】:
二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法,其特征在于:分两次对基因组DNA进行片段化后测序以获得单倍型信息:第一次DNA片段化将基因组DNA分割成为一系列较长的核酸片段,在较长的核酸片段中构建一组片段文库,对每个片段文库进行扩增;将扩增后的较长的核酸片段进行第二次DNA片段化,第二次DNA片段化后得到较短的核酸片段,每个片段文库独立构建测序文库并分别进行高通量测序,测序的结果首先在每个片段文库内部进行序列比对或拼接,获得较长的核酸序列后进行跨片段文库的序列比对和拼接,从而实现利用高通量测序获得基因组单倍型信息。
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