[发明专利]粪便DNA定量甲基化特异性PCR检测试剂盒及其用途在审

专利信息
申请号: 201510079061.6 申请日: 2015-02-13
公开(公告)号: CN104694637A 公开(公告)日: 2015-06-10
发明(设计)人: 金黑鹰;范怡梅;杨青蓝;邓超 申请(专利权)人: 南京市中医院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 南京瑞弘专利商标事务所(普通合伙) 32249 代理人: 陈建和
地址: 210001*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明涉及粪便中检测结肠肿瘤发病相关抑癌基因表观突变试剂盒及其用途。试剂盒包括:(1)结肠肿瘤发病相关的抑癌基因启动子区CpG岛定量甲基化扩增引物3对及探针3条;(2)PCR扩增用试剂。通过本试剂盒得到的PCR扩增产物,可以通过定量甲基化特异性PCR(quantitative methylation specific PCR,qMSP)方法分析基因CpG岛甲基化状态。本试剂盒具有高效的CpG岛甲基化检出作用。用于粪便中结肠肿瘤发病相关抑癌基因表观突变检测。
搜索关键词: 粪便 dna 定量 甲基化 特异性 pcr 检测 试剂盒 及其 用途
【主权项】:
一种粪便中结肠肿瘤发病相关抑癌基因表观突变检测试剂盒,其特征在于包括以下成分:(1)结肠肿瘤发病相关的抑癌基因启动子区CpG岛定量甲基化扩增引物3对、探针3条;(2)PCR扩增用试剂;所说的3对定量甲基化扩增引物序列如下:第1对:SPG20基因qMSP分析引物SPG20‑qMSP,用于扩增SPG20基因启动子区CpG位点处胞嘧啶甲基化的片段;F: 5'‑ TGACGCGAAGCGTTCGAGAGCGCG‑3'R: 5'‑ CGCTCGCCGAAAACCGATCCCGAA‑3';第2对:SNCA基因qMSP分析引物SNCA‑qMSP,用于扩增SNCA基因启动子区CpG位点处胞嘧啶甲基化的片段;F: 5'‑ TTTTTGTTTTTTTATTTTCGTGAGC‑3'R: 5'‑ AAAAAAAACCGCTATAAACCGAC‑3';第3对:FBN1基因qMSP分析引物FBN1‑qMSP,用于扩增FBN1基因启动子区CpG位点处胞嘧啶甲基化的片段F: 5'‑ GGTAGAGATTGTGGGTGTTATAAGC ‑3'R: 5'‑ ACTAAAAAAACGACGACTCCG ‑3';所说的3条定量甲基化分析探针序列如下:第1条:SPG20基因qMSP分析探针SPG20‑probe,用于分析SPG20基因启动子区CpG位点处胞嘧啶甲基化的片段;5'‑6FAM‑CGTAACAACCAAAACGTTCCACG ‑TAMRA ‑3'  ;第2条:SNCA基因qMSP分析探针SNCA‑probe,用于分析SNCA基因启动子区CpG位点处胞嘧啶甲基化的片段;5'‑6FAM‑CGCTAACCTATCGTCGAATAACC ‑TAMRA ‑3';第3条:FBN1基因qMSP分析探针FBN1‑probe,用于分析FBN1基因启动子区CpG位点处胞嘧啶甲基化的片段5'‑6FAM‑CGACGACGACTACTCCCAATCG‑TAMRA ‑3'。
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