[发明专利]一种水稻S5基因的功能性标记S5-n-j-i及基因分型方法

摘要

本发明公开了一种水稻S5基因的功能性标记S5-n-j-i，标记S5-n-j-i由6条引物S5-n-F、S5-n-R、S5-i-F、S5-j-R、S5-O-F和S5-O-R构成。本发明还公开了一种水稻S5基因的功能性标记S5-n-j-i的基因分型方法，具体为：水稻基因组DNA的提取；利用提取的基因组DNA为模板，构建PCR反应体系，加入上述的引物进行PCR扩增；将PCR扩增进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测并进行基因型判定。本发明是应用ARMS-PCR技术和多重PCR技术，不需酶切PCR产物、不需进行多次PCR扩增、不需测序，操作简便、省时且价格低廉。

主权项

一种水稻S5基因的功能性标记S5‑n‑j‑i，其特征在于，所述标记S5‑n‑j‑i由6条引物S5‑n‑F、S5‑n‑R、S5‑i‑F、S5‑j‑R、S5‑O‑F和S5‑O‑R构成，其中，S5‑n‑F的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，具体为：5’‑TATGACCAGCACCATCTTCG‑3S5‑n‑R的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，具体为：5’‑GAGGGACACTCCAACTCGTC‑3S5‑i‑F的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，具体为：5’‑CCCTGATATTCTGAGTTACAAGGCACTC‑3S5‑j‑R的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示，具体为：5’‑GGTCTCGTCAGTGGGCAAGCAGTAGTTT‑3S5‑O‑F的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示，具体为：5’‑GCAAGATGGTGACAGACACGCT‑3S5‑O‑R的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示，具体为：5’‑CAGTGAGTAGGTTGGCCTGTTGATT‑3上述引物序列中带下划线的碱基为引入的错配碱基。