[发明专利]一种DNA测序的图像的磁珠提取方法及装置

摘要

本发明涉及一种DNA测序的图像的磁珠提取方法及装置，包括获取图谱信息，在对每个图谱的采样时间间隔内分别获取DNA图谱；获取DNA图谱的第一像素和第二像素；计算第一像素和第二像素的灰度均值的全局阈值T；计算第一像素和第二像素的方差σ2；若方差在预设范围内，则以T为全局阈值对图谱进行分割；获取四种荧光图像；分别在所述四种荧光图像中，计算磁珠上九个像素的灰度均值提取荧光强度信号；通过荧光强度信号查找磁珠中心点；对中心点进行融合处理，以获得融合后的磁珠中心点。运行时间短，对图像配准效果好，提高对反应芯片的图像识别后，对图像识别的准确性，进而精确对碱基类型的判定。避免了常规图谱中图像模糊不清，磁珠漏查的情况。

主权项

一种DNA测序的图像的磁珠提取方法，其特征在于，包括:获取图谱信息，在对每个图谱的采样时间间隔内分别获取DNA图谱；获取所述DNA图谱的第一像素和第二像素,其中,第一像素A为目标像素,第一像素的灰度值大于或等于初始分割阈值T0,像素总数为N；第二像素B为背景像素,第二像素的灰度值小于初始分割阈值T0,像素总数为M；图谱f(i,j)的最大值为Vmax，最小值为Vmin；其中,T0＝1/2(Vmin+Vmax)    (1)；计算第一像素和第二像素的灰度均值的全局阈值T：T=1/2(Σf(i,j)≥T0f(i,j)N+Σf(i,j)<T0f(i,j)M)---(2);]]>计算第一像素和第二像素的方差σ2：σ2＝(PA+PB)(T‑T0)2   (3)；其中，第一像素的概率为：PA=Σk=1M+NNM+N---(4)]]>第二像素的概率为：PB=Σk=1M+NMM+N---(5)]]>若方差在预设范围内，则以T为全局阈值对所述图谱进行分割；获取CY3、CY5、FAM和TXR四种荧光图像；以所述图谱为基准图像，选定图像变换模型，使用所述图像变换模型对所述四种荧光图像进行配准，得到配准后的荧光图像；分别在所述四种荧光图像中，通过计算磁珠上九个像素的灰度均值提取荧光强度信号；通过所述荧光强度信号查找磁珠中心点；对所述中心点进行融合处理，以获得融合后的磁珠中心点。