[发明专利]一种检测FOXH1基因SNP位点rs750472基因型的方法在审

专利信息
申请号: 201510948472.4 申请日: 2015-12-17
公开(公告)号: CN105441545A 公开(公告)日: 2016-03-30
发明(设计)人: 谢小冬;车团结;尤崇革;沈颂东;李琳;李亚鹏 申请(专利权)人: 苏州百源基因技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京中恒高博知识产权代理有限公司 11249 代理人: 吕玉博
地址: 215011 江苏省苏州市*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明提供一种检测FOXH1基因SNP位点rs750472基因型的方法,步骤如下:(1)构建重组阴性质粒和重组阳性质粒;(2)提取待测样本的外周血基因组DNA,对重组阴性质粒、重组阳性质粒和待测样本的外周血基因组DNA均进行PCR扩增和HRM分析,收集数据;(3)根据收集数据绘制高分辨率溶解曲线,根据重组阴性质粒、重组阳性质粒的溶解曲线判断待测样本FOXH1基因SNP位点rs750472的基因型。本发明的方法能够有效检测FoxH1基因SNP位点rs750472的基因型,灵敏度高,特异性好,检测迅速;应用本发明的方法分析结果与测序结果完全一致,能够可用于室间隔缺损型心脏病的辅助判断。
搜索关键词: 一种 检测 foxh1 基因 snp rs750472 基因型 方法
【主权项】:
一种检测FOXH1基因SNP位点rs750472基因型的方法,其特征在于:步骤如下:(1)构建重组阴性质粒和重组阳性质粒;所述重组阴性质粒的核苷酸序列参见序列表中SEQ ID No.1,所述重组阳性质粒的核苷酸序列参见序列表中SEQ ID No.2;(2)提取待测样本的外周血基因组DNA,对重组阴性质粒、重组阳性质粒和待测样本的外周血基因组DNA均进行PCR扩增和HRM分析,收集数据;作为优选,所述HRM分析的条件为:94℃ 90s;60℃ 30s;83‑94℃收集数据,温度上升速率为0.06℃/s;(3)根据收集数据绘制高分辨率溶解曲线,根据重组阴性质粒、重组阳性质粒的溶解曲线判断待测样本FOXH1基因SNP位点rs750472的基因型:与重组阴性质粒的溶解曲线重合则FOXH1基因SNP位点rs750472的基因型为TT;与重组阳性质粒的溶解曲线重合则FOXH1基因SNP位点rs750472的基因型为GG;在重组阴性质粒和重组阳性质粒的溶解曲线之间的则FOXH1基因SNP位点rs750472的基因型为TG。
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