[发明专利]SIMM法快速定位突变性状相关基因在审
申请号: | 201511025040.2 | 申请日: | 2015-12-30 |
公开(公告)号: | CN105734122A | 公开(公告)日: | 2016-07-06 |
发明(设计)人: | 严维;何航;陈竹锋;张文辉;卢嘉威;唐晓艳 | 申请(专利权)人: | 深圳市作物分子设计育种研究院;四川新博育前沿生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 518107 广东省深圳市光*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及一种SIMM法快速定位突变性状相关基因的方法和应用,属于生物信息学与功能基因组学领域,本方法可应用到无准确野生型基因组的水稻突变体基因克隆中,可大大提高水稻功能基因克隆的效率,满足广大水稻基因功能研究者的需求。 | ||
搜索关键词: | simm 快速 定位 突变 性状 相关 基因 | ||
【主权项】:
一种鉴定突变体中性状相关基因的方法,其特征在于所述方法,包括以下步骤:a)将确定为单基因调控的突变体与野生型材料进行杂交,获得杂合F1植株后自交,得到F2群体;b)挑选F2中具有突变表型的纯合植株,混样提取DNA,进行高通量测序;c)对原始测序数据进行质检并过滤,通过比较分析,寻找突变体特异的SNP位点;d)根据突变体中的SNP评价参数在染色体上的分布情况,获得候选功能基因区域;e)对候选区域内基因进行筛选,获得候选SNP位点。
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