[发明专利]2型糖尿病唾液蛋白指纹图谱分子诊断模型建立方法在审
申请号: | 201610209047.8 | 申请日: | 2016-04-06 |
公开(公告)号: | CN105699663A | 公开(公告)日: | 2016-06-22 |
发明(设计)人: | 吴正治;孙珂焕;曹美群;黄飞娟;杨长青 | 申请(专利权)人: | 深圳市老年医学研究所;吴正治 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68 |
代理公司: | 北京国昊天诚知识产权代理有限公司 11315 | 代理人: | 刘戈 |
地址: | 518020 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种2型糖尿病唾液蛋白指纹图谱分子诊断模型建立方法,包括以下步骤:样品收集;样品预处理;纳米磁珠活化;唾液样品上样;纳米磁珠洗脱;数据采集;数据分析;建立诊断模型。本发明采用液态芯片联合MALDI技术检测2型糖尿病患者的唾液蛋白质指纹图谱,从唾液蛋白质中筛选出80个有极显著的统计学意义的差异蛋白峰,选择质荷比为2082.92、2499.24和2426.77三个差异蛋白质峰进行建模,识别率为94.3%,预测能力93.3%。临床回代检验结果表明,该诊断模型的灵敏度为88.6%,特异度为77.8%。说明该模型对2型糖尿病的诊断效率优良,灵敏度高、特异性强。 | ||
搜索关键词: | 糖尿病 唾液 蛋白 指纹 图谱 分子 诊断 模型 建立 方法 | ||
【主权项】:
一种2型糖尿病唾液蛋白指纹图谱分子诊断模型建立方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)样品收集;(2)样品预处理:收集的唾液样品在2h内置于转速3000r/min的4℃低温离心机离心10min,并按照50μl/管分装于冻存管,置于‑80℃冰箱冷冻保存备用;(3)纳米磁珠活化;(4)唾液样品上样:④取5μl唾液样品,加10μl的U9裂解液,混合孵育30min后,加入185μl的Wash Buffer稀释;⑤向含有活化磁珠的PCR管中加入100μl处理好的唾液样品,室温孵育30min,置于磁铁上孵育1min,去除上清液;⑥再往管中加入100μl的Wash Buffer洗脱5min,然后将PCR管置于磁铁上孵育1min,去除上清液;⑦重复步骤⑥一次;(5)纳米磁珠洗脱:每个PCR管中加入10μl的Elution Buffer,洗脱5min,放置于磁铁上孵育1min,取5μl上清液移至另一个PCR管中,并加入5μl的CHCA饱和溶液充分混匀,吸取2μl混合溶液加样到Au/Steel芯片上,风干,然后上机读取芯片,收集数据;(6)数据采集;(7)数据分析;(8)建立诊断模型:采用决策树算法计算出多个变量变化对两样本的判别价值,确定诊断模型。
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