[发明专利]测序文库构建中5’和3’接头连接副产物的去除方法有效
| 申请号： | 201610406827.1 | 申请日： | 2016-06-12 |
| 公开（公告）号： | CN107488655B | 公开（公告）日： | 2021-07-09 |
| 发明（设计）人： | 吴立刚;杨其元 | 申请（专利权）人： | 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心 |
| 主分类号： | C12N15/10 | 分类号： | C12N15/10;C12P19/34;C12Q1/6869;C40B50/06 |
| 代理公司： | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人： | 韦东 |
| 地址： | 200031 上海*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及测序文库构建中5’和3’接头连接副产物的去除方法。具体而言，本发明提供一种切割RNA‑DNA：cDNA杂交双链体的方法，所述方法包括混合Cas酶、sgRNA和所述RNA‑DNA：cDNA杂交双链体的步骤；其中，该杂交双链体中的DNA部分包含该Cas酶识别的前间区序列邻近基序(PAM序列)；该sgRNA能特异性结合该cDNA链的一部分；和该Cas酶能特异性识别该sgRNA，并切割所述杂交双链体；任选地，所述RNA‑DNA：cDNA杂交双链体产生于RNA测序文库的构建过程中；以及任选地，所述RNA为RNA测序文库构建过程中使用的5’接头，所述DNA为RNA测序文库构建过程中使用的3’接头。 | ||
| 搜索关键词： | 序文 构建 接头 连接 副产物 去除 方法 | ||
【主权项】：
一种切割RNA‑DNA：cDNA杂交双链体的方法，其特征在于，所述方法包括混合Cas酶、sgRNA和所述RNA‑DNA：cDNA杂交双链体的步骤；其中，该杂交双链体中的DNA部分包含该Cas酶识别的前间区序列邻近基序(PAM)；该sgRNA能特异性结合该cDNA链的一部分；和该Cas酶能特异性识别该sgRNA，并切割所述杂交双链体；任选地，所述RNA‑DNA：cDNA杂交双链体产生于RNA测序文库的构建过程中；以及任选地，所述RNA为RNA测序文库构建过程中使用的5’接头，所述DNA为RNA测序文库构建过程中使用的3’接头。
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