[发明专利]新生抗原分析

摘要

癌症免疫学为癌症治疗提供了有希望的新途径，但是验证待针对为靶标的潜在的新生抗原是成本高的且昂贵的。分析MHC结合亲和力、抗原加工、与已知抗原的相似性、预测的表达水平(作为mRNA或蛋白质)、自相似性和突变体等位基因频率，提供了使用测序数据鉴定并优先化候选新生抗原的筛选方法。本发明的方法通过鉴定优先候选新生抗原以用于进一步的实验验证从而节省时间和金钱。

主权项

1.一种用于优先化对于患者的候选新生抗原的方法，所述方法包括以下步骤：获得多个候选新生抗原；确定所述多个候选新生抗原的成员的自相似性；确定所述多个候选新生抗原的成员与已知抗原的相似性；确定所述多个候选新生抗原的成员的表达水平；鉴定对所述多个候选新生抗原的成员编码的外显子中的突变体等位基因频率；及将规则应用于所述确定步骤和鉴定步骤的结果，以根据临床显著性的可能性对所述多个候选新生抗原的成员进行排序。