[发明专利]一种RNA高通量测序文库的构建方法在审

专利信息
申请号: 201710029646.6 申请日: 2017-01-16
公开(公告)号: CN108315824A 公开(公告)日: 2018-07-24
发明(设计)人: 刘月星;李辉辉 申请(专利权)人: 刘月星;李辉辉
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06
代理公司: 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 代理人: 汤东凤
地址: 200090 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明提供一种能够对所有不带poly(A)尾的RNA进行高通量测序文库构建的方法,本发明方法覆盖所有不带poly(A)尾的RNA,包括线性RNA和环状RNA。线性的不带poly(A)尾的RNA,可以直接利用本发明方法或在打断后进行高通量测序文库构建;环状RNA在打断后,可以利用本发明方法进行高通量测序文库构建。首先,进行末端延伸反应,使上述的RNA在3’末端延伸出一段同聚物序列。然后,进行连接反应后,使其5’端连接上接头R5A。待连接反应后,对上述RNA连接产物进行纯化,再利用特异的逆转录引物RTP进行逆转录反应,获得相应的cDNA一链。最后,利用与高通量测序平台匹配的引物进行PCR扩增,即可得到高通量测序文库。值得一提的是,本发明方法在灵敏度上得到了较大提升,尤其适用于微量样品中低起始量RNA的高通量测序文库的构建。
搜索关键词: 测序文库 高通量 构建 连接反应 末端延伸 环状RNA 打断 高通量测序 逆转录反应 逆转录引物 连接产物 微量样品 灵敏度 起始量 上接头 同聚物 再利用 引物 匹配 覆盖
【主权项】:
1.一种RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)进行末端延伸反应,使不带poly(A)尾的RNA在3’末端延伸出一段序列;(2)进行连接反应,使上述RNA在其5’端连接上接头R5A,得到RNA连接产物;(3)对上述RNA连接产物进行纯化;(4)利用特异的逆转录引物RTP对上述纯化后的RNA连接产物进行逆转录反应,获得相应的cDNA一链;(5)进行PCR扩增富集,即得到高通量测序文库。
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