[发明专利]一种桑树病原菌高通量鉴定及种属分类方法及其应用有效
| 申请号： | 201710064067.5 | 申请日： | 2017-01-24 |
| 公开（公告）号： | CN106868116B | 公开（公告）日： | 2020-12-11 |
| 发明（设计）人： | 刘吉平;刘希;陈杰湖 | 申请（专利权）人： | 华南农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;G16B30/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人： | 任重 |
| 地址： | 510642 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： |
本发明公开了一种桑树病原菌高通量鉴定及种属分类的方法。本发明通过收集桑树病叶或感病部位的器官；提取桑树病叶或感病部位的器官的总DNA；Illumina DNA文库构建；Illumina高通量测序；去除测序数据中桑树基因组序列；组装微生物基因组序列；组装完整核糖体DNA序列；筛选标记微生物核糖体DNA序列；对比分析核糖体DNA序列进行种属分类实现对桑树病原菌的鉴定及种属分类。结果显示，运用本发明方法对桑树黑斑病病原菌进行鉴定及种属分类，共鉴定出16种真菌，其中相对丰度最高的为 |
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| 搜索关键词： | 一种 桑树 病原菌 通量 鉴定 种属 分类 方法 及其 应用 | ||
【主权项】：
一种桑树病原菌高通量鉴定及种属分类方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：S1.收集桑树病叶或感病部位的器官；S2.提取桑树病叶或感病部位的器官的总DNA；S3. Illumina DNA文库构建；S4. Illumina高通量测序；S5.去除测序数据中桑树基因组序列；S6.组装微生物基因组序列；S7.组装完整核糖体DNA序列；S8.筛选标记微生物核糖体DNA序列；S9.对比分析核糖体DNA序列进行种属分类；步骤S3所述Illumina DNA文库构建的方法为：依照 Illumina 文库构建流程，将所述步骤S2中所述总DNA构建为片段大小400～600bp的双末端高通量测序文库。
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