[发明专利]用于检测黄瓜果实表皮细胞结构的SNP标记方法有效
申请号: | 201710145415.1 | 申请日: | 2017-03-13 |
公开(公告)号: | CN106702017B | 公开(公告)日: | 2020-04-03 |
发明(设计)人: | 张圣平;顾兴芳;苗晗;张松;王烨 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 吴泳历 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明“用于检测黄瓜果实表皮细胞结构的SNP标记方法”,涉及生物技术辅助育种领域。用于检测黄瓜果实表皮细胞结构的SNP标记方法,其中所述标记引物的核苷酸序列为:dcaps—RsaI—F:GGGAACAATATTATTTTTGGAGTA/dcaps—RsaI—R:TGATTCCTATTACCTTCAACCTCA;以黄瓜基因组DNA为模板,以上述引物为前后引物进行PCR扩增,获得一个158bp的片段,该片段第26个碱基为SNP20114537A/C。片段如Seq ID No.1所示,则果实为栅栏状表皮细胞;片段如Seq ID No.2所示,则果实为扁平状表皮细胞;采用本发明获得的SNP标记,可以在黄瓜候选材料的任何阶段判断其果实表皮细胞结构为栅栏状还是扁平状,该标记具有高效、限制少的优点,提高了选育果实具有栅栏状表皮细胞的加工型黄瓜材料和具有扁平状表皮细胞的鲜食型黄瓜材料的效率,缩短了育种周期。 | ||
搜索关键词: | 用于 检测 黄瓜 果实 表皮 细胞 结构 snp 标记 方法 | ||
【主权项】:
一种用于检测黄瓜果实表皮细胞结构的SNP标记的引物,其特征在于:其核苷酸序列如下:dcaps—RsaI—F:GGGAACAATATTATTTTTGGAGTAdcaps—RsaI—R:TGATTCCTATTACCTTCAACCTCA所述引物扩增的与黄瓜果实栅栏状表皮细胞基因Pe连锁的特征条带核苷酸序列如Seq ID No.1所示,序列的26位碱基为A,经RsaI酶切后得到158bp片段;所述引物扩增的与黄瓜果实扁平状表皮细胞基因pe连锁的特征条带核苷酸序列如Seq ID No.2所示,序列的26位碱基为C,经RsaI酶切后得到134bp片段。
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