[发明专利]一种快速检测水产品中耐药菌多样性的方法在审
申请号: | 201710514252.X | 申请日: | 2017-06-29 |
公开(公告)号: | CN107058607A | 公开(公告)日: | 2017-08-18 |
发明(设计)人: | 赵勇;牛丽;巴永兵;赵飞;刘海泉 | 申请(专利权)人: | 上海海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 上海唯智赢专利代理事务所(普通合伙)31293 | 代理人: | 吴瑾瑜 |
地址: | 201306 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明涉及分子生物学领域,公开了一种快速检测识别水产品中耐药菌多样性的方法。先用不同类型和浓度的抗生素筛选,从水产样品中分离耐药性程度不同的耐药菌,提取DNA,根据细菌16S rDNA V3可变区设计一对通用引物进行PCR扩增,DGGE电泳分离片段并回收;再次扩增后测序,可实现快速检测水产品中耐药菌多样性。本方法成本低、容易操作,能够直观、快速地观察到水产品中不同耐药菌的种类和群落结构;实现对不同地方和不同来源的水产品中耐药菌中生物群落的多样性和动力学变化进行比较直观的分析。 | ||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 水产品 耐药 多样性 方法 | ||
【主权项】:
一种快速检测水产品中耐药菌多样性的方法,其特征在于,步骤包括:(1)水产品样品匀浆并涂布在含不同浓度、类型抗生素的培养基上培养;(2)分别提取收集菌体,获得水产品中的总菌及耐受不同浓度、类型抗生素的耐药菌,并提取DNA;(3)PCR扩增并纯化;(4)DGGE电泳和成像;(5)回收目的条带,获取总菌和耐药菌DNA重新扩增并测序;(6)分析测序结果,确定水产品样品中筛选的总菌和耐药菌特异性菌株,判断不同选择条件下水产品样品的菌株及其多样性。
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