[发明专利]一种肠道内容物宏基因组DNA提取的前处理方法有效
申请号: | 201710830797.1 | 申请日: | 2017-09-15 |
公开(公告)号: | CN107475250B | 公开(公告)日: | 2019-04-05 |
发明(设计)人: | 张杰豪;束文圣;周集中;叶脉;徐卓菲;刘玉莲 | 申请(专利权)人: | 广东美格基因科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 518000 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种肠道内容物宏基因组DNA提取的前处理方法。本发明前处理方法是在肠道内容物样品中加入去腐剂清洗2遍,再加入去核酸酶溶液清洗,通过冻融法、裂解法对细胞进行裂解,充分释放其中的DNA,最后加入蛋白酶K、SDS和RNA酶去除细胞里面的蛋白质、纤维和RNA,所得产物经常规方法即可得到肠道内容物宏基因组DNA。本发明前处理方法对于杂食性动物的肠道内容物宏基因组DNA的提取有明显的效果,提取的纯度及提取量都能满足PCR扩增、高通量测序等下游实验,具有很强的实用性。 | ||
搜索关键词: | 肠道内容物 宏基因组 前处理 清洗 高通量测序 核酸酶溶液 杂食性动物 细胞 蛋白酶K 提取量 冻融 腐剂 裂解 去除 蛋白质 纤维 释放 | ||
【主权项】:
1.一种肠道内容物宏基因组DNA提取的前处理方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)在肠道内容物样品中加入去腐剂清洗2遍、离心去上清;(2)加入去腐剂和1mM的EDTA溶液清洗;(3)通过冻融法并加入10mg/ml的溶菌酶对细胞进行裂解;(4)在65℃下加入蛋白酶K、摩尔质量为10%的SDS去除蛋白质和纤维;(5)加入终浓度为20mg/ml的RNA酶去除RNA;其中,所述去腐剂包括0.5M的EDTA、1M的Tris‑HCl、0.1M的NaH2PO4、0.1M的Na2HPO4和1.5M的NaCl;步骤(1)中,所述肠道内容物样品为鱼类的前肠道内容物、中肠道内容物和/或后肠道内容物。
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