[发明专利]用于乳粉中双歧杆菌菌株鉴定的SNP位点组合有效
申请号: | 201710887563.0 | 申请日: | 2017-09-27 |
公开(公告)号: | CN107604082B | 公开(公告)日: | 2018-09-25 |
发明(设计)人: | 刘洋;窦同海;段文锋;周雁;陈雯雯;俞漪;张清平;曲勤凤 | 申请(专利权)人: | 上海市质量监督检验技术研究院;复旦大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6858;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 上海华工专利事务所(普通合伙) 31104 | 代理人: | 赵孟琴;缪利明 |
地址: | 200233 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种用于乳粉中双歧杆菌菌株鉴定的SNP位点组合。本发明还公开了用于鉴定乳粉中双歧杆菌菌株的HRM方法以及所述的SNP位点组合在鉴定乳粉中双歧杆菌菌株中的应用。通过本发明的SNP位点组合物和HRM方法,可以实现对乳粉中的双歧杆菌菌株的精确鉴定。 | ||
搜索关键词: | 双歧杆菌菌株 乳粉 组合本 应用 | ||
【主权项】:
1.用于乳粉中双歧杆菌菌株鉴定的SNP位点组合,其特征在于,所述组合包括4个SNP位点,分别为BXY位点、HIK1位点、HIK2位点和YKE位点,所述BXY位点如下:1)BXY位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种DSM 10140全基因组的F链5’端起第617884位碱基,其碱基为C;2)BXY位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种Bb‑12全基因组的F链5’端起第1253257位碱基,其碱基为C;3)BXY位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种B1‑04全基因组的F链5’端起第617882位碱基,其碱基为C;4)BXY位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种Bi‑07全基因组的F链5’端起第617883位碱基,其碱基为T;所述HIK1位点如下:1)HIK1位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种DSM 10140全基因组的F链5’端起第776139位碱基,其碱基为C;2)HIK1位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种Bb‑12全基因组的F链5’端起第1411376位碱基,其碱基为T;3)HIK1位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种B1‑04全基因组序的F链5’端起第776136位碱基,其碱基为T;4)HIK1位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种Bi‑07全基因组的F链5’端起第776137位碱基,其碱基为T;所述HIK2位点如下:1)HIK2位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种DSM 10140全基因组的R链3’端起第777041位碱基,其碱基为A;2)HIK2位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种Bb‑12全基因组的R链3’端起第1412278位碱基,其碱基为C;3)HIK2位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种B1‑04全基因组的R链3’端起第777038位碱基,其碱基为A;4)HIK2位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种Bi‑07全基因组的R链3’端起第777039位碱基,其碱基为A;所述YKE位点如下:1)YKE位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种DSM 10140全基因组的R链3’端起第839428位碱基,其碱基为T;2)YKE位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种Bb‑12全基因组的R链3’端起第1474481位碱基,其碱基为T;3)YKE位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种B1‑04全基因组的R链3’端起第839425位碱基,其碱基为C;4)YKE位点为动物双歧杆菌乳双歧杆菌亚种Bi‑07全基因组的R链3’端起第839426位碱基,其碱基为C。
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