[发明专利]一种鉴别石斛属植物的方法在审

专利信息
申请号: 201711002452.3 申请日: 2017-10-24
公开(公告)号: CN107604089A 公开(公告)日: 2018-01-19
发明(设计)人: 陈军文;张敬丽;刘涛;蔡金龙;赵艳;谢世清;张广辉;范伟;杨生超 申请(专利权)人: 云南农业大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895
代理公司: 昆明正原专利商标代理有限公司53100 代理人: 陈左,于洪
地址: 650201 云南*** 国省代码: 云南;53
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摘要: 发明涉及一种鉴别石斛属植物的方法,属于分子标记技术领域。本发明对样本进行总DNA提取;之后用ITS5F/4R引物扩增,接着使用CodonCode Aligner对扩增产物测序峰图进行校对拼接,去除低质量序列及引物区,用ClustalXv2.0进行多重序列比对后,去除俩端的多余序列,将处理后的序列使用Mega6.0软件计算序列的K‑2‑P距离,分析比较序列的种内种间遗传距离,并构建系统进化树,从而通过对不同种石斛的ITS序列的聚类来区分石斛物种。本发明解决了现有技术存在难以用传统的表型特征或理化分析等方法来鉴别石斛属植物的技术问题,能够快速、简便并且准确地鉴别石斛属植物。
搜索关键词: 一种 鉴别 石斛 植物 方法
【主权项】:
一种鉴别石斛属植物的方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)对待鉴定样本进行总DNA提取;(2)以步骤(1)提取的总DNA为模板,用SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物进行PCR扩增,获得扩增产物;(3)使用CodonCode Aligner对扩增产物测序峰图进行校对拼接,去除低质量序列及引物区,用ClustalXv2.0进行多重序列比对后,去除俩端的多余序列,处理后的序列用于下一步的序列分析;使用Mega6.0软件计算序列的K‑2‑P距离,分析比较序列的种内种间遗传距离,并构建系统进化树,从而通过对不同种石斛的ITS序列的聚类来区分石斛物种。
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