[发明专利]鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1(ITS1)通用引物设计方法及应用在审

专利信息
申请号: 201711348352.6 申请日: 2017-12-15
公开(公告)号: CN107881248A 公开(公告)日: 2018-04-06
发明(设计)人: 龚理;孔晓瑜 申请(专利权)人: 浙江海洋大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 杭州浙科专利事务所(普通合伙)33213 代理人: 吴秉中
地址: 316000 浙江省舟*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明公开了鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1(ITS1)通用引物设计方法及应用。有益效果为本发明所公开的引物设计方法是基于核糖体内转录间隔区1(ITS1)两端保守的18S rDNA和5.8S rDNA序列设计,所得到的引物特异性极强,扩增的ITS1进化速率相对较快,在种内基本趋于相似,而在种间则表现出显著的差异;将该引物用于鳎科鱼类,准确度高,克服了形态特征鉴定的缺陷,解决了种质混杂的问题。
搜索关键词: 鲽形目鳎科 鱼类 核糖 体内 转录 间隔 its1 通用 引物 设计 方法 应用
【主权项】:
鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1(ITS1)通用引物设计方法,其特征在于:所述方法包括以下步骤:1)从Genbank获取鳎科鱼类18S rDNA和5.8S rDNA序列,利用ClustalXv1.83做序列的比对,分别在3’端和5’端找出保守序列,作为引物候选区;2)利用OLIGO v6软件对候选区序列进行分析,设定引物序列选择条件。
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