[发明专利]判断基因组中目标基因拷贝数的方法在审
申请号: | 201711482313.5 | 申请日: | 2017-12-29 |
公开(公告)号: | CN108103154A | 公开(公告)日: | 2018-06-01 |
发明(设计)人: | 李阳 | 申请(专利权)人: | 武汉艾德士生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 董建林;徐瑛 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区高新大*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明公开了判断基因组中目标基因拷贝数的方法,用待测物种的基因组中一个已知拷贝数的基因作为内参基因A;构建一个基因片段ABm,其上含有相同拷贝数的A序列的突变片段Am和待检测目标基因B的突变片段Bm;调整浓度使体系中A和ABm的摩尔比接近1:1的水平,构建两个体系的PCR反应:分别用于扩增内参基因A和A的突变片段Am,以及用于扩增目标基因B和B的突变片段Bm,分析两个体系中A:Am的摩尔比值An和B:Bm的摩尔比值Bn,则待检测目标基因B的拷贝数N=X*Bn/An。本发明通过加入内参基因的方式,利用简单的普通PCR技术,快速判断目标基因的拷贝数,方法巧妙,抗干扰能力强,结果稳定,成本低廉,分辨率高,是目标基因拷贝数鉴定的突破性方法。 | ||
搜索关键词: | 目标基因 拷贝数 突变片段 内参基因 基因组 构建 扩增 抗干扰能力 拷贝数鉴定 基因片段 快速判断 摩尔比 分辨率 检测 物种 基因 分析 | ||
【主权项】:
1.判断基因组中目标基因拷贝数的方法,其特征在于,用待测物种的基因组中一个已知拷贝数的基因作为内参基因A,记为拷贝数为X的内参基因A;构建一个基因片段ABm,其上含有相同拷贝数的内参基因A序列的突变片段Am和待检测目标基因B的突变片段Bm;在PCR体系中加入基因组模板和ABm,调整浓度使体系中A和ABm的摩尔比接近1:1的水平,构建两个体系的PCR反应:第一个体系中设计一对引物PA-F/PA-R用于扩增内参基因A和A的突变片段Am,第二个体系中设计一对引物PB-F/PB-R用于扩增目标基因B和B的突变片段Bm,两个体系中都用相同的混合的基因组和ABm片段的DNA作为模板,PA-F/PA-R的扩增产物为A/Am,PB-F/PB-R的扩增产物为B/Bm,分析两个体系中A:Am的摩尔比值An和B:Bm的摩尔比值Bn,则待检测目标基因B的拷贝数N=X*Bn/An。
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