[发明专利]一种蜕皮激素类似物的筛选方法及先导化合物在审
| 申请号： | 201810010234.2 | 申请日： | 2018-01-05 |
| 公开（公告）号： | CN108231206A | 公开（公告）日： | 2018-06-29 |
| 发明（设计）人： | 张莉;胡雪萍;胡松;董雅雯;王家哲 | 申请（专利权）人： | 中国农业大学 |
| 主分类号： | G16H70/40 | 分类号： | G16H70/40 |
| 代理公司： | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人： | 张雪娇;赵青朵 |
| 地址： | 100083 北京市海淀*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种蜕皮激素类似物的筛选方法，包括：S1)确定活性口袋；S2)依据受体‑配体药效团模型与配体药效团模型筛选SPECS库，建立数据库1；S3)对数据库1中的化合物进行聚类及类药性分析，建立数据库2；S4)将数据库2中的化合物与受体对接建立数据库3，筛选其受体结合活性，得到虚拟筛选的化合物；S5)筛选数据库2中化合物与受体的结合活性，得到虚拟筛选的化合物；S6)将虚拟筛选的化合物进行蜕皮激素受体结合活性测定，得到命中的先导化合物；S7)基于所述命中的先导化合物进行相似性检索。本发明提供的虚拟筛选方法可降低实验筛选化合物的数量，缩短研发周期，降低经济成本。 | ||
| 搜索关键词： | 筛选 建立数据库 先导化合物 虚拟 蜕皮激素类似物 药效团模型 数据库 结合活性 配体 受体结合活性 蜕皮激素受体 相似性检索 活性口袋 经济成本 实验筛选 药性分析 聚类 研发 | ||
【主权项】：
1.一种蜕皮激素类似物的筛选方法，其特征在于，包括：S1)从Protein Data Bank中获取EcR/USP二聚体与配体共晶复合物的三维结构，比对分析，确定活性口袋；S2)根据活性口袋构建受体‑配体药效团模型与配体药效团模型，并依据受体‑配体药效团模型与配体药效团模型筛选SPECS库，符合条件的化合物建立数据库1；S3)对所述数据库1中的化合物进行聚类及类药性分析，选择符合条件的化合物建立数据库2；S4)利用分子对接程序，将所述数据库2中的化合物与受体对接，建立数据库3，采用QSAR模型预测筛选数据库3中化合物的受体结合活性，得到第一批虚拟筛选的化合物；S5)采用MM‑PBSA方法预测筛选数据库2中化合物与受体的结合活性，得到第二批虚拟筛选的化合物；S6)将所述第一批虚拟筛选的化合物与第二批虚拟筛选的化合物进行蜕皮激素受体结合活性测定，得到命中的先导化合物；S7)基于所述命中的先导化合物对所述SPECS库中的化合物进行相似性检索，得到第三批虚拟筛选的化合物；其中，所述步骤S4)与步骤S5)并无先后顺序之分。
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