[发明专利]全基因组肿瘤突变负荷预测方法、设备以及存储介质有效

专利信息
申请号: 201810264479.8 申请日: 2018-03-28
公开(公告)号: CN108009400B 公开(公告)日: 2018-07-06
发明(设计)人: 施巍炜;王凯;秦公炜;张鹏 申请(专利权)人: 至本医疗科技(上海)有限公司
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18;G06F19/24
代理公司: 上海百一领御专利代理事务所(普通合伙) 31243 代理人: 王奎宇;甘章乖
地址: 200120 上海市浦东新区(*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明提供了一种全基因组肿瘤突变负荷预测方法、设备以及存储介质,其中的全基因组肿瘤突变负荷预测方法,其特征在于,包括以下步骤:存储用于预测全基因组肿瘤突变负荷的预测模型;获取基于样本探针的突变负荷获得过程得到的目标区域的目标肿瘤突变负荷;预测待测样本的全基因组肿瘤突变负荷,其中,采用预测模型,基于获取的目标肿瘤突变负荷的输入,预测得到待测样本的全基因组肿瘤突变负荷,预测模型的公式为:y=ax+b,式中,y为预测得到的全基因组肿瘤突变负荷;x为目标肿瘤突变负荷;a和b为模型参数;用于计算目标肿瘤突变负荷的测序长度的范围为1.0‑2.6MB。
搜索关键词: 突变 全基因组 肿瘤 负荷预测 目标肿瘤 预测模型 存储介质 待测样本 预测 计算目标 模型参数 目标区域 测序 式中 探针 样本 存储
【主权项】:
1.一种全基因组肿瘤突变负荷预测方法,其特征在于,包括以下步骤:存储用于预测待测样本的全基因组肿瘤突变负荷的预测模型;获取基于样本探针的突变负荷获得过程得到的目标区域的目标肿瘤突变负荷;预测所述待测样本的所述全基因组肿瘤突变负荷,其中,采用所述预测模型,基于获取的所述目标肿瘤突变负荷的输入,预测得到所述待测样本的所述全基因组肿瘤突变负荷,所述预测模型的公式为:y=ax+b,式中,y为预测得到的所述全基因组肿瘤突变负荷;x为所述目标肿瘤突变负荷;a和b为模型参数,a的取值范围为1.3‑4.0,b的取值范围为‑1.1‑2.0;用于计算所述目标肿瘤突变负荷的测序长度的范围为1.0‑2.6MB。
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