[发明专利]一种用于副猪嗜血杆菌分子分型的全基因组测序方法在审
| 申请号： | 201810364415.5 | 申请日： | 2018-04-23 |
| 公开（公告）号： | CN108588198A | 公开（公告）日： | 2018-09-28 |
| 发明（设计）人： | 闫鹤;万锈琳;李春玲 | 申请（专利权）人： | 华南理工大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/21 |
| 代理公司： | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人： | 何淑珍;江裕强 |
| 地址： | 510640 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种用于副猪嗜血杆菌分子分型的全基因组测序方法。该方法通过全基因组序列在副猪嗜血杆菌MLST分型数据库中找到7个看家基因（rpoB、atpD、g3pd、infB、mdh、_6pgd、frdB），并确定看家基因的等位基因号及序列型，包括样品预处理、提取基因组DNA、质量检测与测序，采用DNAMAN软件对测序结果进行多序列比对与分析，获得菌株序列型（ST）。同时发现了3个新的等位基因及两株副猪嗜血杆菌ST型均为新型。该技术流程可以用于副猪嗜血杆菌分类鉴定和遗传多样性研究。 | ||
| 搜索关键词： | 副猪嗜血杆菌 测序 等位基因 分子分型 看家基因 全基因组 遗传多样性研究 提取基因组DNA 全基因组序列 多序列比对 分型数据库 样品预处理 技术流程 质量检测 菌株 分类 分析 发现 | ||
【主权项】：
1.一种用于副猪嗜血杆菌分子分型的全基因组测序方法，包括样品预处理、提取基因组DNA、质量检测与测序、获取看家基因序列、数据分析，其特征在于：获取看家基因序列时不需要设计看家基因引物，用DNAMAN软件对全基因组序列进行比对，得到看家基因序列。
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