[发明专利]一种基于表观遗传学修饰差异的靶基因的检测方法

摘要

本发明公开一种基于表观遗传学修饰差异的靶基因的检测方法，包括：抽提不同组别样本的外周血游离DNA；针对不同待测靶基因和/或同一靶基因的不同待测区域片段分别设计引物对组；利用引物对组分别对不同组别样本外周血游离DNA在高温变性条件下和低温变性条件下进行实时荧光定量PCR扩增，得到待测靶基因xn和/或同一靶基因待测区域片段xn的△Ctxn；进一步利用回归分析对△Ctxn进行加权计算并得到阈值，据此鉴别或溯源表观遗传学修饰差异的靶基因所在的组别或不同的来源。本发明通过对不同靶基因/或同一靶基因不同区域表观遗传学修饰差异的分析，为鉴别或溯源靶基因的不同来源提供了新的更加便捷的方法。

主权项

1.一种基于表观遗传学修饰差异的靶基因的检测方法，其特征在于，所述方法包括：抽提不同组别样本的外周血游离DNA；针对不同待测靶基因和/或同一靶基因的不同待测区域片段设计引物对组；利用引物对组分别对不同组别样本的外周血游离DNA在高温变性条件下和低温变性条件下进行实时荧光定量PCR扩增，得到待测靶基因xn和/或同一靶基因待测区域片段xn的△Ctxn；其中，△Ctxn＝|Ctxn‑HT–Ctxn‑LT|，待测靶基因xn和/或同一靶基因待测区域片段xn在高温变性条件下的Ct值标记为Ctxn‑HT，待测靶基因xn和/或同一靶基因待测区域片段xn在低温变性条件下的Ct值标记为Ctxn‑LT；利用回归分析对不同待测靶基因和/或同一靶基因不同待测区域片段的△Ctxn进行加权计算，具体公式为：△Ct加权值＝a1*△Ctx1+a2*△Ctx2+……+an*△Ctxn；其中，△Ctx1，△Ctx2，……，△Ctxn为不同待测靶基因和/或同一靶基因不同待测区域片段的△Ct值；a,a2,……,an为回归分析对不同靶基因和/或同一靶基因的不同区域片段对应的△Ct值给出的加权系数；根据△Ct加权值得到的阈值鉴别或溯源表观遗传学修饰差异的靶基因所在的组别。