[发明专利]临床血液样本分析方法及应用在审

专利信息
申请号: 201810538149.3 申请日: 2018-05-30
公开(公告)号: CN110554134A 公开(公告)日: 2019-12-10
发明(设计)人: 曾嵘;吴家睿;李辰;李青润;袁亚俊 申请(专利权)人: 中国科学院上海生命科学研究院
主分类号: G01N30/89 分类号: G01N30/89
代理公司: 31100 上海专利商标事务所有限公司 代理人: 韦东
地址: 200031 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及临床血液样本分析方法及应用。具体而言,本发明提供一种免疫细胞蛋白质定量方法,所述方法包括:提供免疫细胞蛋白质的肽段混合物;以数据依赖性采集模式(DDA)和数据非依赖采集模式(DIA)采集数据,获得DDA数据和DIA数据;对DDA数据进行数据检索,获得检索结果;由获得的检索结果构建谱图库;将DIA数据与谱图库对比,对DIA和谱图库中的谱图匹配程度进行打分,依据样品中掺入的各标肽的保留时间对样品中肽段保留时间进行矫正,优化拟合的模型,完成DIA的数据库检索;和导出DIA匹配结果,依据阈值筛选高可信肽段集合,用于肽段和蛋白质定量。
搜索关键词: 图库 肽段 蛋白质定量 采集模式 检索结果 免疫细胞 数据库检索 数据依赖性 肽段混合物 采集数据 临床血液 匹配结果 数据检索 样本分析 阈值筛选 保留 掺入 导出 构建 拟合 矫正 蛋白质 匹配 集合 可信 应用 优化
【主权项】:
1.一种免疫细胞蛋白质定量方法,其特征在于,所述方法包括:/n(1)提供免疫细胞蛋白质的肽段混合物;/n(2)以数据依赖性采集模式(DDA)和数据非依赖采集模式(DIA)采集数据,获得DDA数据和DIA数据;/n(3)对DDA数据进行数据检索,获得检索结果;/n(4)由步骤(3)获得的检索结果构建谱图库;/n(5)将步骤(2)获得的DIA数据与步骤(4)获得的谱图库对比,对DIA和谱图库中的谱图匹配程度进行打分,依据样品中掺入的各标肽的保留时间对样品中肽段保留时间进行矫正,优化拟合的模型,完成DIA的数据库检索;和/n(6)导出DIA匹配结果,依据阈值筛选出可信肽段的集合,用于肽段和蛋白质定量。/n
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