[发明专利]一种构建基于淋巴瘤基因检测的高通量测序文库的方法及其应用在审

专利信息
申请号: 201810587424.0 申请日: 2018-06-06
公开(公告)号: CN108823640A 公开(公告)日: 2018-11-16
发明(设计)人: 周剑峰;何旭华;肖敏 申请(专利权)人: 珠海铂华生物工程有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12Q1/6869
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 俞梁清
地址: 519031 广东省珠海市横琴新*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了一种构建基于淋巴瘤基因检测的高通量测序文库的方法及其应用,包括以下步骤:针对目的基因建立引物库,利用所述引物库中的引物获取目标DNA片段构建形成所述高通量测序文库,一种用于构建上述的基于淋巴瘤基因检测的高通量测序文库的试剂盒,包含至少一种引物,所述引物选自所述引物库。将上述试剂盒用于淋巴瘤基因的高通量测序方法,包括以下步骤:利用所述试剂盒中的引物构建测序文库后,针对测序文库进行测序分析;其中,所述测序分析的具体操作为:将提取的各个目标DNA片段的核苷酸序列进行读取并记录,生成数据文件,并对所述数据文件进行分析处理。与现有技术相比,本发明方案在高通量测序过程中具有低起始量、检测广泛、灵敏度高、准确性高、适用范围广、实用性强等优点。
搜索关键词: 测序文库 构建 高通量 淋巴瘤 引物 基因检测 试剂盒 引物库 高通量测序 测序分析 数据文件 读取 目标DNA片段 核苷酸序列 分析处理 获取目标 目的基因 灵敏度 起始量 应用 基因 检测 记录
【主权项】:
1.一种构建基于淋巴瘤基因检测的高通量测序文库的方法,其特征在于:包括以下步骤:针对目的基因建立引物库,利用所述引物库中的引物获取目标DNA片段构建形成所述高通量测序文库,其中,所述目的基因包括ABL1、ACTG1、AKT1、ARID1A、ATM、ATP6AP1、ATP6V1B2、B2M、BCL10、BCL11B、BCL2、BCL6、BCOR、BIRC3、BRAF、BTG1、BTG2、BTK、CARD11、CASP10、CCND1、CCND3、CCR4、CCR7、CD28、CD58、CD70、CD79A、CD79B、CD83、CDKN1B、CDKN2A、CHD2、CNOT3、CREBBP、CRLF2、CTNNB1、CXCR4、DDX3X、DIS3、DNM2、DNMT3A、DTX1、DUSP2、EBF1、EED、EGR1、EGR2、EIF2A、EP300、ETV6、EZH2、FAM46C、FAS、FAT1、FBXW7、FGFR3、FLT3、FOXO1、FYN、GATA3、GNA13、GNAQ、GPR183、HIF1A、HIST1H1B、HIST1H1C、HIST1H1D、HIST1H1E、HNRNPA2B1、HRAS、HVCN1、ID3、IDH1、IDH2、IGLL5、IKBKB、IKZF1、IKZF3、IL7R、IRF4、ITPKB、JAK1、JAK2、JAK3、KDM6A、KIT、KLF2、KLHL6、KMT2C、KMT2D、KRAS、LTB、MAP2K1、MAP3K14、MAPK1、MAX、MED12、MEF2B、MYC、MYD88、NF1、NFE2、NFKBIE、NOTCH1、NOTCH2、NRAS、NT5C2、PAX5、PHF6、PIK3CA、PIK3R1、PIM1、PLCG1、PLCG2、POT1、POU2AF1、POU2F2、PRDM1、PRKCB、PTEN、PTPN1、PTPN11、RB1、RHOA、RPL10、RPS15、RRAGC、SAMHD1、SETD2、SF3B1、SGK1、SH2B3、SMARCA4、SMARCB1、SOCS1、STAT3、STAT5B、STAT6、TBL1XR1、TCF3、TET1、TET2、TMSB4X、TNFAIP3、TNFRSF14、TNFRSF1B、TP53、TRAF3、TRRAP、U2AF1、USP7、VAV1、VMA21、WHSC1、WT1和XPO1。
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