[发明专利]肝移植中HLA-C1/C2基因PCR-SSP快速鉴定方法在审

专利信息
申请号: 201810591798.X 申请日: 2018-06-08
公开(公告)号: CN108796050A 公开(公告)日: 2018-11-13
发明(设计)人: 邓志辉;陈瑞 申请(专利权)人: 深圳市血液中心
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12Q1/6883
代理公司: 深圳市世纪恒程知识产权代理事务所 44287 代理人: 胡海国;邵柱
地址: 518000 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明基于HLA‑C1/C2基因的序列特征和HLA‑C基因组全长序列的单核苷酸多态性(SNPs),采用HLA‑C位点特异性PCR引物和HLA‑C1/C2组特异性引物扩增策略,即设计一条共用的HLA‑C基因特异性PCR扩增引物,分别与一条针对HLA‑C1的组特异性PCR引物、一条针对HLA‑C2的组特异性PCR引物进行配组,仅用2个PCR反应分别扩增HLA‑C1、C2基因;由于所用引物具有相近的退火温度,可在同一PCR扩增条件下进行同步扩增;扩增产物经琼脂糖电泳检测,可清晰直观地判定受检者的HLA‑C1/C2基因型,无需大型贵重设备、无需对当前国际上IMGT/HLA数据库已公布的3800余种HLA‑C等位基因进行基因分型;具有实验操作简单、所需时间短、成本低,适合于肝移植前对肝供体进行快速检测,以减少急性排斥、提高移植效果。
搜索关键词: 特异性PCR引物 肝移植 扩增 引物 基因 单核苷酸多态性 琼脂糖电泳检测 特异性PCR扩增 退火 特异性引物 位点特异性 等位基因 贵重设备 基因分型 急性排斥 快速检测 快速鉴定 扩增产物 全长序列 实验操作 同步扩增 序列特征 供体 配组 判定 数据库 直观 移植 清晰
【主权项】:
1.肝移植中HLA‑C1/C2基因PCR‑SSP快速鉴定方法,其特征在于:采用一条HLA‑C基因特异性PCR扩增引物,分别与一条针对HLA‑C1的组特异性PCR引物、一条针对HLA‑C2的组特异性PCR引物配组,在同一PCR扩增条件下分别特异性扩增HLA‑C1及HLA‑C2基因;所述HLA‑C1基因特异性PCR扩增引物包括:上游引物HLA‑C‑F2和下游引物HLA‑C1‑RD,其中,所述上游引物HLA‑C‑F2的序列为:5'‑CCAATCAGCGTCTMCGCAGTC‑3',位于5’‑启动子区域,在HLA‑C基因组全长序列中的位置为:nt‑77~nt‑57;所述下游引物HLA‑C1‑RD的序列为:5'‑TCTGGTTGTAGTAGCCGCGCAGG‑3',位于第2外显子,在HLA‑C基因组全长序列中的位置为:nt442~nt464;所述HLA‑C2基因特异性PCR扩增引物包括上游引物HLA‑C‑F2和下游引物HLA‑C2‑RB,其中,所述上游引物HLA‑C‑F2的序列为:5'‑CCAATCAGCGTCTMCGCAGTC‑3',位于5’‑启动子区域,在HLA‑C基因组全长序列中的位置为:nt‑77~nt‑57;所述下游引物HLA‑C2‑RB的序列为:5'‑TCTGGTTGTAGTAGCCGCGCAGT‑3',位于第2外显子,在HLA‑C基因组全长序列中的位置为:nt442~nt464。
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