[发明专利]一种检测磺脲类个体化用药相关基因SNP位点的引物及方法在审
申请号: | 201810741794.5 | 申请日: | 2018-07-09 |
公开(公告)号: | CN108866180A | 公开(公告)日: | 2018-11-23 |
发明(设计)人: | 李鹏;齐琳洁;冷欢 | 申请(专利权)人: | 西安医臻生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/686;C12N15/11 |
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地址: | 710000 陕西省西安市沣*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | 本发明涉及一种用于检测磺脲类个体化用药相关基因SNP位点的引物及方法,所述的引物可对TCF7L2基因rs7903146(C/T)位点进行检测,所述的引物序列包括野生型上游引物、突变型上游引物、共用下游引物;本发明在ARMS‑PCR基础上做了改进,针对SNP序列设计的特异性引物及共用下游引物,特异性引物于3’末端第三位引入错配碱基,以此扩大特异性引物3’末端碱基与DNA模版上SNP位点碱基互补和不互补情况下扩增效率间的差距,从而大幅度提高检测的特异性和准确性;引入Real‑time PCR技术,可根据△ct值进行判读,即△Ct=突变Ct-野生Ct,一般情况下△Ct>7为野生型,△Ct<‑7为突变型,‑2<△Ct<2为杂合型。本发明的优点是,操作简单、结果直观,检测时间短,成本低且特异性高。 | ||
搜索关键词: | 特异性引物 引物 个体化用药相关基因 检测 上游引物 下游引物 磺脲类 突变型 野生型 错配碱基 碱基互补 扩增效率 末端碱基 序列设计 引物序列 引入 杂合型 种检测 判读 位点 突变 直观 基因 改进 | ||
【主权项】:
1.一种检测磺脲类个体化用药相关基因SNP位点的引物,其特征在于,其对TCF7L2基因rs7903146(C/T)位点进行检测;所述用于TCF7L2基因rs7903146(C/T)位点检测的引物序列包括:野生型上游引物、突变型上游引物及共用下游引物,具体为:SEQ ID NO.01:CAATTAGAGAGCTAAGCACTTTTTAGGTAC,SEQ ID NO.02:AGAGAGCTAAGCACTTTTTAGGTAT,SEQ ID NO.03:CAAGCTAACACTAATGAAGAGGACA。
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