[发明专利]一种人粪便总DNA亚硫酸盐转化及回收纯化的方法在审

专利信息
申请号: 201810814365.6 申请日: 2018-07-23
公开(公告)号: CN108949746A 公开(公告)日: 2018-12-07
发明(设计)人: 王军一;肖雯;王巍;刘杰;舒平;尚慧捷;高金龙 申请(专利权)人: 杭州和壹基因科技有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/6806
代理公司: 杭州中成专利事务所有限公司 33212 代理人: 唐银益
地址: 310051 浙江省杭州*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明提供一种人粪便总DNA亚硫酸盐转化及纯化的方法,采用热变性法95℃10‑20分钟后,立即冰置5‑10分钟防止复性,然后将DNA在75℃进行转化45‑60分钟,并采用磁珠法以及含PEG6000/8000的结合液对转化DNA进行纯化,能够得到高转化率、高质量的甲基化DNA,有利于甲基化检测的标准化及全自动化操作,用于后续粪便样本中人源DNA中基因的甲基化水平分析。
搜索关键词: 亚硫酸盐 人粪便 转化 总DNA 全自动化操作 甲基化检测 甲基化水平 甲基化DNA 粪便样本 高转化率 磁珠法 结合液 热变性 源DNA 冰置 复性 标准化 回收 基因 分析
【主权项】:
1.一种人粪便总DNA亚硫酸盐转化及回收纯化的方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)在2.0mL离心管中加入1‑3000ug的待处理人粪便总DNA;(2)在步骤(1)离心管中加入100‑300μL亚硫酸盐转化溶液、30‑50μL保护溶液,盖紧离心管后,涡旋混匀,瞬时离心;(3)将步骤(2)离心管密闭置于恒温振荡孵育器中,95℃静置孵育10~20分钟;(4)立即将步骤(3)离心管取出,放置冰上5‑10分钟;(5)将步骤(4)离心管从冰上取出,颠倒混匀,瞬时离心,将离心管置于恒温振荡孵育器中,75℃静置孵育45‑60分钟;(6)瞬时离心步骤(5)反应后的离心管,向其中加入1000μL磁珠结合溶液、100‑200μL混匀的磁珠溶液,涡旋混匀,其中,磁珠预先混匀且室温平衡至少30分钟;(7)将步骤(6)离心管置于23℃的恒温振荡孵育器中,转速1000rpm,孵育45‑60分钟;(8)瞬时离心离心管后,将其置于磁力架2‑5分钟,待磁珠分离后,弃除上清液;(9)将步骤(8)离心管从磁力架上取下,加入800μL磁珠结合溶液;涡旋混匀重悬磁珠;重复步骤(8);(10)将步骤(9)离心管从磁力架上取下,加入800μL洗涤液;涡旋混匀后重复步骤(8);(11)将步骤(10)离心管从磁力架上取下,加入600μL洗涤液;涡旋混匀后重复步骤(8);(12)瞬时离心步骤(11)离心管后,将其置于磁力架2‑5分钟,去除残留液体;(13)打开步骤(12)离心管的管盖,将离心管放置于恒温振荡孵育器中;23℃静置15分钟,等待磁珠干燥,静置时不要震荡;(14)向步骤(13)离心管加入35μL洗脱液;盖好离心管;涡旋混匀重悬磁珠;将离心管放入恒温振荡孵育器中,23℃,1000rpm,孵育10分钟;(15)瞬时离心步骤(14)离心管后,将其置于磁力架2‑5分钟,将洗脱液转移至新的无DNase无RNase酶的1.5mL离心管中;‑80℃保存备用。
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