[发明专利]一种DNA甲基化定量系统有效
申请号: | 201810845927.3 | 申请日: | 2018-07-27 |
公开(公告)号: | CN109385465B | 公开(公告)日: | 2019-12-24 |
发明(设计)人: | 禹汇川;骆衍新;白亮亮;唐冠楠;王小琳;李英杰;黄增鸿;黄美近;汪建平 | 申请(专利权)人: | 中山大学附属第六医院;中山大学 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858 |
代理公司: | 11111 北京市万慧达律师事务所 | 代理人: | 谢敏楠;张孟迪 |
地址: | 510000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及一种DNA甲基化定量系统。该系统包括获取待测DNA样品中,甲基化和非甲基化待测CpG的量的采集构件,以及通过甲基化/(甲基化+非甲基化)×100计算甲基化百分比参数PMR的处理构件。该系统不仅适用于CpG岛内的共甲基化CpG位点的甲基化定量,还尤其适用于针对侧翼序列没有CpG位点的DNA甲基化定量。该方法不需要对照反应和完全甲基化的DNA标准品作为参照,从而可以克服它们带来的缺陷,具有更高的重复性和准确性。 | ||
搜索关键词: | 甲基化 定量系统 非甲基化 采集构件 侧翼序列 处理构件 | ||
【主权项】:
1.一种DNA甲基化定量系统,其特征在于,包括以下构件:/na)采集构件:所述的采集构件用于采集待测DNA样品的甲基化DNA的量和非甲基化DNA的量;/nb)处理构件:所述处理构件采用甲基化/(甲基化+非甲基化)×100计算甲基化百分比参数percent of methylated referenc,PMR;/n所述的采集构件包括:/n1)转化模块:所述的转化模块用于将DNA样品的非甲基化的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶碱基保持不变;/n2)扩增模块:所述的扩增模块用于扩增转化后的DNA样品;/n所述扩增模块含有至少一对引物和至少一对覆盖待测单个CpG位点的寡核苷探针扩增转化后的DNA样品;/n其中,所述的寡核苷酸探针结合MGB;/n其中,所述的一对覆盖待测单个CpG位点的寡核苷酸探针,其中一条特异性结合CG序列,另一条特异性结合TG序列;/n其中,所述的待测CpG位点位于探针中间靠3’端的区域;/n其中,所述的探针5’端靠近正向引物的3’端。/n
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