[发明专利]评估目标区域文库的建库污染程度的方法和优化文库构建的方法在审
申请号: | 201811108518.1 | 申请日: | 2018-09-21 |
公开(公告)号: | CN110938683A | 公开(公告)日: | 2020-03-31 |
发明(设计)人: | 林莉娅;罗礼华;武靖华;张伟;刘晓 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 孙银行;彭家恩 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 一种评估目标区域文库的建库污染程度的方法和优化文库构建的方法,其中评估目标区域文库的建库污染程度的方法包括:提供多个合成模板、真实样本和阴性样本作为建库起始材料,合成模板是指根据所述目标区域的已知序列合成的模板序列,真实样本是指包含目标区域序列的样本,阴性样本是指不含任何核酸材料的样本;在建库用多孔板上分别使用合成模板、真实样本和阴性样本进行文库构建,获得测序文库;对测序文库进行上机测序获得测序数据,然后将测序数据比对到目标区域的参考序列,获得比对正确的有效数据;根据合成模板、真实样本和阴性样本各自的有效数据,评估各文库的污染来源及其比例。该方法能够有效评估和控制建库中的污染。 | ||
搜索关键词: | 评估 目标 区域 文库 污染 程度 方法 优化 构建 | ||
【主权项】:
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