[发明专利]一种基于概率统计模型的生物学全同胞鉴定方法

摘要

本发明涉及生物遗传学技术领域，特别涉及一种基于概率统计模型的生物学全同胞鉴定方法。本发明所提供的基于概率统计模型的生物学全同胞鉴定方法，对两名被鉴定人进行n个相互独立的STR基因座分型，依据IBS在无亲缘关系个体对人群中的二项分布IBS～B(2n，π0)和在全同胞对人群中的二项分布IBS～B(2n,π1)，即可计算得到两名被鉴定人为无亲缘关系个体的概率pH0和二者为全同胞的概率pH1。本发明所述基于概率统计模型的生物学全同胞鉴定方法适用于任意数量的STR基因座，且分析效率高，因此，本发明所提供的技术方案具有广阔的应用前景与不错的市场潜力。

主权项

1.一种基于概率统计模型的生物学全同胞鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：使用DNA提取试剂盒，分别提取两名被鉴定人的生物检材基因组DNA；S2：进行PCR扩增，实施STR分型，以获得n个相互独立的STR基因座的分型结果；S3：建立检验假设：原假设H0：两名被鉴定人为无亲缘关系个体；备择假设H1：两名被鉴定人为生物学全同胞；S4：依据两名被鉴定人的STR基因座的基因型，比较并计算各STR基因座上存在的相同等位基因的个数，累计得到两名被鉴定人在全部STR基因座上存在的相同等位基因的总数，即IBS值；S5：依据各STR基因座在人群中的等位基因频率，得到IBS在无亲缘关系个体对人群中符合二项分布IBS～B(2n，π0)，IBS在全同胞对人群中符合二项分布IBS～B(2n,π1)；其中，以a2＝1、a1＝1、a0＝1分别表示在任一STR基因座上存在2个相同的等位基因、仅存在1个相同的等位基因、无相同的等位基因的状态各自成立，a2、a1、a0分别为0时则表示上述各状态各自不成立；设任一STR基因座有m个等位基因，并以fi表示该STR基因座上第i个等位基因的频率，其中i＝1,2,3……m，则有：以p2、p1、p0分别表示无亲缘关系个体对A与B之间a2、a1、a0取值为1的概率，则有：p2+p1+p0＝1其中，因此，在无亲缘关系个体对人群中的IBS的期望值E(IBS)为：在无亲缘关系个体对人群中的IBS的总体率π0为：以p2FS、p1FS分别表示全同胞对C与D之间a2、a1取值为1的概率，则有：因此，在全同胞对人群中的IBS的期望值E(IBS)为：在全同胞对人群中的IBS的总体率π1为：S6：使用EXCEL软件中的BINOMDIST函数进行计算：输入参数BINOMDIST(IBS值，2n，π0，FALSE)以计算出两名被鉴定人为无亲缘关系个体的概率pH0；输入参数BINOMDIST(IBS值，2n，π1，FALSE)以计算出两名被鉴定人为全同胞的概率pH1；S7：遗传学证据价值评估：当pH1>pH0时，计算pH1与pH0的比值R1，其意义为：两名被鉴定人为全同胞的概率是二者为无亲缘关系个体的概率的R1倍；当pH1

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