[发明专利]一种基因编辑方法在东方拟无枝酸菌中的应用在审

专利信息
申请号: 201811552697.8 申请日: 2018-12-18
公开(公告)号: CN109609537A 公开(公告)日: 2019-04-12
发明(设计)人: 倪瑶;魏维;钱秀萍;夏兴;戈梅 申请(专利权)人: 上海交通大学;上海来益生物药物研究开发中心有限责任公司
主分类号: C12N15/74 分类号: C12N15/74;C12N15/90;C12N15/65;C12N15/54;C12N1/21;C12N15/11;C12R1/01
代理公司: 上海华工专利事务所(普通合伙) 31104 代理人: 缪利明;赵孟琴
地址: 200030 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种基于CRISPR/Cas9编辑系统在东方拟无枝酸菌中进行基因敲除与敲入的方法,该方法将CRISPR/Cas9编辑质粒pLYNY04引入东方拟无枝酸菌Amycolatopsis orientalis HCCB10007中,同时实现了基因敲除与敲入,可以简化遗传操作,提高东方拟无枝酸菌的整合效率。本发明还公开了一种含有gtfD基因同源臂的CRISPR/Cas9编辑质粒pLYNY04,将eGFP插入东方拟无枝酸菌的靶标序列,以便于检测基因编辑结果。本发明还公开了一种含有gtfD基因同源臂的CRISPR/Cas9编辑质粒pLYNY04的应用。
搜索关键词: 东方拟无枝酸菌 质粒 基因 基因敲除 同源臂 编辑结果 编辑系统 遗传操作 靶标 整合 应用 引入 检测
【主权项】:
1.一种基于CRISPR/Cas9编辑系统在东方拟无枝酸菌中进行基因敲除与敲入的方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一、构建含有Cas9和sgRNA的骨架质粒pKCpGcas9EgdgtfD‑NA;步骤二、构建含有eGFP的靶标序列同源臂;步骤三、含有gtfD基因同源臂的编辑质粒pLYNY04的构建将步骤一的骨架质粒pKCpGcas9EgdgtfD‑NA使用限制性内切酶进行线性化;接着,使用同源重组试剂盒将步骤二的带有eGFP的靶标序列同源臂整合到线性化的pKCpGcas9EgdgtfD‑NA中,获得含有gtfD基因同源臂的编辑质粒pLYNY04;步骤四、将编辑质粒pLYNY04电转化入A.orientalis HCCB10007将步骤三得到的含有gtfD基因同源臂的编辑质粒pLYNY04电转入感受态A.orientalis HCCB10007细胞,同时实现eGFP的敲入以及定点靶标序列的敲除。
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