[发明专利]一种基于HLA分型与结构的肿瘤新抗原的筛选方法有效
| 申请号： | 201910041526.7 | 申请日： | 2019-01-16 |
| 公开（公告）号： | CN110675913B | 公开（公告）日： | 2022-04-12 |
| 发明（设计）人： | 张崇骞;赵永浩;马赛;闫成海;张晓霞;J·彭;D·张 | 申请（专利权）人： | 倍而达药业（苏州）有限公司 |
| 主分类号： | G16B15/30 | 分类号： | G16B15/30 |
| 代理公司： | 北京华夏正合知识产权代理事务所(普通合伙) 11017 | 代理人： | 韩登营;曲芳兵 |
| 地址： | 215123 江苏省苏州市吴*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种基于HLA分型与结构的肿瘤新抗原的筛选方法，包括：A、获取肿瘤组织细胞的突变基因所对应编码的多肽序列，并将其作为潜在抗原的多肽集合；B、获取HLA分型在黄种人群中的频率超过指定阈值的HLA分型集合；并将多肽集合与所述HLA分型集合进行亲和力预测，选出亲和力超过指定阈值的多肽序列；C、将HLA分型集合中的HLA进行三维结构建模；以及将多肽序列进行三维结构建模；D、将HLA作为受体，将多肽序列作为配体进行分子对接；E、将打分超过指定阈值时对应的多肽序列作为肿瘤新抗原的候选多肽序列。由上，通过本申请的筛选方法，方便后续进一步的据此进行针对性的实验，可以大大的减少实验的次数，实现省时、省力且节约经费。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 hla 结构 肿瘤 抗原 筛选 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于HLA分型与结构的肿瘤新抗原的筛选方法，其特征在于，包括步骤：/nA、获取肿瘤组织细胞的突变基因所对应编码的各个多肽序列，并将其作为潜在抗原的多肽集合；/nB、获取各个HLA分型在黄种人群中的频率并据此获取频率超过指定阈值的HLA分型集合；并将所述多肽集合中的多肽序列与所述HLA分型集合中的HLA分型分别进行亲和力预测，并筛选出亲和力超过指定阈值的多肽序列；/nC、将所述HLA分型集合中的各个HLA分型分别进行三维结构建模；以及将所述亲和力超过指定阈值的多肽序列分别进行三维结构建模；/nD、将HLA分型的三维结构模型作为受体，将多肽序列的三维结构模型作为配体进行分子对接；/nE、将所述分子对接的打分值中超过指定阈值时对应的多肽序列作为肿瘤新抗原的候选多肽序列。/n
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