[发明专利]一种淡水鱼类线粒体12S通用宏条形码扩增引物及其应用方法有效
申请号: | 201910341512.7 | 申请日: | 2019-04-26 |
公开(公告)号: | CN109943645B | 公开(公告)日: | 2023-04-14 |
发明(设计)人: | 杨江华;张效伟 | 申请(专利权)人: | 南京易基诺环保科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 江苏瑞途律师事务所 32346 | 代理人: | 陈彬;蒋海军 |
地址: | 211100 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种淡水鱼类线粒体12S通用宏条形码扩增引物及其应用方法,属于生物技术领域。本发明依据常见淡水鱼类线粒体12S基因序列设计了16条宏条形码扩增引物,包括6条上游引物和10条下游引物,该引物对对鱼类群落覆盖度广、扩增效率高,引物组合可以扩增出长度为70bp至350bp的产物,兼容不同高通量测序平台,这种多引物组合的方法可以降低非特异性扩增,提高PCR成功率,可广泛用作特征条码序列进行鱼类物种鉴定、鱼类多样性分析等研究。 | ||
搜索关键词: | 一种 淡水 鱼类 线粒体 12 通用 条形码 扩增 引物 及其 应用 方法 | ||
【主权项】:
1.一种淡水鱼类线粒体12S通用宏条形码扩增引物,其特征在于:包括至少一条上游引物和一条下游引物组合的引物对,所述的上游引物为Fish‑F1:TCGTGCCAGCCACCGCGGTTA、Fish‑F2:AACGTCAGGTCGAGGTGTAGCG、Fish‑F3:AGCATCTCNCTTACACNGAGAA、Fish‑F4:GTACCTTTTGCATCATGATTTAG、Fish‑F5:AGAAAGCGTTAAAGCTC、Fish‑F6:GAAGACCCTNTGGAGCTT;所述的下游引物为Fish‑R1.1:ATAGTGGGGTATCTAATCCCAG、Fish‑R1.2:TTNTAGAACAGGCTCCTCTAGG、Fish‑R2.1:AGAGTGACGGGCGGTGTGTNCG、Fish‑R2.2:TTCTCNGTGTAAGNGAGATGCT、Fish‑R3.1:TTCCCTTGCGGTACTTTNTCTAT、Fish‑R3.2:CTAAATCATGATGCAAAAGGTAC、Fish‑R4:CCACTCTTTTGCCACAGAGACG、Fish‑R5:TCTTNTTACTCATNTTAGC、Fish‑R6.1:CCGNGGTCGCCCCAACC、Fish‑R6.2:AACTNGGTNCGTTGATCGG。
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