[发明专利]一种捕获RNA原位高级结构及相互作用的方法有效
| 申请号： | 201910384194.2 | 申请日： | 2019-05-09 |
| 公开（公告）号： | CN111909991B | 公开（公告）日： | 2021-08-03 |
| 发明（设计）人： | 薛愿超;蔡兆奎;曹唱唱 | 申请（专利权）人： | 中国科学院生物物理研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 张立娜 |
| 地址： | 100101*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种捕获RNA原位高级结构及相互作用的方法。该方法包括：固定细胞或组织中蛋白质介导的RNA相互作用；在保持细胞完整的情况下行膜穿孔；降解游离RNA；在RNA3’末端行pCp‑biotin标记并原位近端连接；细胞消解后纯化含C‑biotin的嵌合体RNA；构建链特异性文库；高通量测序。本发明在不破坏细胞结构、保持细胞完整的情况下，原位处理胞内RNA，捕获生理状态下RNA分子内(间)相互作用；用pCp‑biotin标记RNA末端，非变性条件下原位连接，极大提高标记效率，同时降低分子间非特异连接；用C1磁珠能高效富集标记C‑biotin的嵌合体RNA，增加测序有效数据比例，降低测序成本。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 捕获 rna 原位 高级 结构 相互作用 方法 | ||
【主权项】：
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