[发明专利]一种基于全基因组SNP信息划分种猪血统的方法

摘要

本发明公开了一种基于全基因组SNP信息对种猪进行血统划分的方法。先对划分对象采集身体组织，提取DNA，通过某种基因分型技术对每个体的基因组SNP进行分型，通过质控，筛选出合格的SNP位点。通过基因组SNP基因型计算个体间的加性遗传相关值，然后用1减去该值作为两两个体之间的“距离”，接下来对两两组合通过R语言“hclust”函数进行聚类分析，取0.9844作为划分血统的阈值。本发明相对传统血统划分方法，得到的结果清晰简洁，并且充分吸收了来自父母双方传递的等位基因信息，对血统的划分具有更高的可靠性。

主权项

1.一种基于全基因组SNP信息进行种猪血统划分的方法，其特征在于，通过挖掘猪个体基因组的SNP基因型，通过基因组数据计算两两个体间的加性遗传相关，然后确定血统划分的阈值，通过聚类分析将所有种猪划分到不同血统中。