[发明专利]一种香蕉水通道蛋白基因启动子转录因子的筛选方法在审
申请号: | 201910521135.5 | 申请日: | 2019-06-17 |
公开(公告)号: | CN110229930A | 公开(公告)日: | 2019-09-13 |
发明(设计)人: | 许奕;宋顺;李敬阳;金志强;徐碧玉;王安邦;李羽佳;黄东梅;魏卿 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院海口实验站;中国热带农业科学院热带生物技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/6897 | 分类号: | C12Q1/6897;C40B30/04 |
代理公司: | 重庆百润洪知识产权代理有限公司 50219 | 代理人: | 刘立春 |
地址: | 570100 *** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | 本发明公开了一种香蕉水通道蛋白基因启动子转录因子的筛选方法,包括以下步骤,判断启动子的核心区域,根据香蕉A基因组设计启动子的引物进行扩增,扩增长度为1362bp,通过plantcare和PLACE分析其顺式作用元件,进行启动子GUS活性的检测,通过染色情况来判断启动子的核心区域B,酵母单杂交筛选与启动子互作的转录因子,用酵母单杂交的方法进行验证,将启动子核心区域B作为诱饵区段构建诱饵载体,筛选酵母干旱处理的香蕉单杂交文库。本发明鉴定出在干旱胁迫条件下,与MaPIP1;1启动子直接结合的转录因子,更加方便对香蕉水通道蛋白基因的研究,有助于提升转基因香蕉的抗旱能力,有助于进一步理解MaPIP1;1的抗旱机制。 | ||
搜索关键词: | 启动子 转录因子 核心区域 通道蛋白 香蕉水 筛选 基因启动子 酵母单杂交 香蕉 干旱胁迫条件 顺式作用元件 转基因香蕉 干旱处理 抗旱能力 区段构建 诱饵载体 直接结合 单杂交 染色 酵母 扩增 文库 引物 诱饵 抗旱 验证 基因 检测 分析 研究 | ||
【主权项】:
1.一种香蕉水通道蛋白基因启动子转录因子的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:判断启动子的核心区域,根据香蕉A基因组设计启动子的引物进行扩增,扩增长度为1362bp,通过plantcare和PLACE分析其顺式作用元件,进行启动子GUS活性的检测,通过染色情况来判断启动子的核心区域B;S2:酵母单杂交筛选与启动子互作的转录因子,用酵母单杂交的方法进行验证,将启动子核心区域B作为诱饵区段构建诱饵载体,筛选酵母干旱处理的香蕉单杂交文库,确定与核心区域B序列相互作用的结合蛋白,获取转率因子C信息;S3:进一步验证转率因子C与核心区域B的相互作用,qRT‑PCR检测干旱胁迫处理下的结合蛋白,获取能够能够协同核心区域B基因响应干旱胁迫的结合蛋白D;S4:进一步证明转率因子C与核心区域B的启动子区域结合,进行体外互作验证,进行了双荧光素酶的测定。
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