[发明专利]一种香蕉水通道蛋白基因启动子转录因子的筛选方法在审

专利信息
申请号: 201910521135.5 申请日: 2019-06-17
公开(公告)号: CN110229930A 公开(公告)日: 2019-09-13
发明(设计)人: 许奕;宋顺;李敬阳;金志强;徐碧玉;王安邦;李羽佳;黄东梅;魏卿 申请(专利权)人: 中国热带农业科学院海口实验站;中国热带农业科学院热带生物技术研究所
主分类号: C12Q1/6897 分类号: C12Q1/6897;C40B30/04
代理公司: 重庆百润洪知识产权代理有限公司 50219 代理人: 刘立春
地址: 570100 *** 国省代码: 海南;46
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摘要: 发明公开了一种香蕉水通道蛋白基因启动子转录因子的筛选方法,包括以下步骤,判断启动子的核心区域,根据香蕉A基因组设计启动子的引物进行扩增,扩增长度为1362bp,通过plantcare和PLACE分析其顺式作用元件,进行启动子GUS活性的检测,通过染色情况来判断启动子的核心区域B,酵母单杂交筛选与启动子互作的转录因子,用酵母单杂交的方法进行验证,将启动子核心区域B作为诱饵区段构建诱饵载体,筛选酵母干旱处理的香蕉单杂交文库。本发明鉴定出在干旱胁迫条件下,与MaPIP1;1启动子直接结合的转录因子,更加方便对香蕉水通道蛋白基因的研究,有助于提升转基因香蕉的抗旱能力,有助于进一步理解MaPIP1;1的抗旱机制。
搜索关键词: 启动子 转录因子 核心区域 通道蛋白 香蕉水 筛选 基因启动子 酵母单杂交 香蕉 干旱胁迫条件 顺式作用元件 转基因香蕉 干旱处理 抗旱能力 区段构建 诱饵载体 直接结合 单杂交 染色 酵母 扩增 文库 引物 诱饵 抗旱 验证 基因 检测 分析 研究
【主权项】:
1.一种香蕉水通道蛋白基因启动子转录因子的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:判断启动子的核心区域,根据香蕉A基因组设计启动子的引物进行扩增,扩增长度为1362bp,通过plantcare和PLACE分析其顺式作用元件,进行启动子GUS活性的检测,通过染色情况来判断启动子的核心区域B;S2:酵母单杂交筛选与启动子互作的转录因子,用酵母单杂交的方法进行验证,将启动子核心区域B作为诱饵区段构建诱饵载体,筛选酵母干旱处理的香蕉单杂交文库,确定与核心区域B序列相互作用的结合蛋白,获取转率因子C信息;S3:进一步验证转率因子C与核心区域B的相互作用,qRT‑PCR检测干旱胁迫处理下的结合蛋白,获取能够能够协同核心区域B基因响应干旱胁迫的结合蛋白D;S4:进一步证明转率因子C与核心区域B的启动子区域结合,进行体外互作验证,进行了双荧光素酶的测定。
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