[发明专利]针对丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-raf(BRAF)的SRM/MRM测定在审
| 申请号： | 201910658572.1 | 申请日： | 2015-07-13 |
| 公开（公告）号： | CN110412288A | 公开（公告）日： | 2019-11-05 |
| 发明（设计）人： | 大卫·B·克里茨曼;托德·哈姆布拉夫;史诺·塞帕洛姆比尔;辽卫礼 | 申请（专利权）人： | 爱科谱迅病理研究公司 |
| 主分类号： | G01N33/68 | 分类号： | G01N33/68 |
| 代理公司： | 北京润平知识产权代理有限公司 11283 | 代理人： | 刘依云;乔雪微 |
| 地址： | 美国马*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 本发明提供了来自丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B‑raf(BRAF)的具体的肽和这些肽的衍生电离特性，其特别有利于通过选择反应监测(SRM)质谱或也可称作多反应监测(MRM)质谱的方法直接定量已经在福尔马林中固定的生物样品中的BRAF蛋白质。这类生物样品是经化学保藏和固定的，该生物样品选自使用含有试剂/固定剂的甲醛处理的组织和细胞，包括福尔马林固定的组织/细胞、福尔马林固定/石蜡包埋(FFPE)的组织/细胞、FFPE组织块和来自那些块的细胞，以及经福尔马林固定和或石蜡包埋的组织培养细胞。使用Liquid Tissue试剂和方案从该生物样品中制备蛋白质样品并通过在蛋白质样品中定量至少一种或多种所描述的肽来使用SRM/MRM质谱的方法在Liquid Tissue样品中定量BRAF蛋白质。这些肽在其以修饰的或未修饰的形式存在时可被定量。BRAF肽的修饰的形式的一个示例是肽序列内酪氨酸、苏氨酸、丝氨酸和/或其他氨基酸残基的磷酸化。 | ||
| 搜索关键词： | 福尔马林 生物样品 固定的 质谱 修饰 细胞 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 蛋白质样品 石蜡包埋 蛋白质 选择反应监测 组织培养细胞 氨基酸残基 多反应监测 化学保藏 甲醛处理 固定剂 酪氨酸 类生物 磷酸化 丝氨酸 苏氨酸 组织块 肽序列 电离 制备 | ||
【主权项】：
1.一种用于检测和定量蛋白质消化物中的BRAF片段肽的含量的试剂在制备用于测量福尔马林固定组织的生物样品中BRAF酪氨酸激酶受体蛋白质BRAF水平的试剂中的应用，其中所述片段肽为如选自以下组成的组中的一种氨基酸序列SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10和SEQ ID NO:11所示的肽，且其中所述BRAF片段肽的含量使用质谱进行检测和定量；且其中所述水平是相对水平或绝对水平。
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