[发明专利]一套用于构建桃DNA指纹图谱的SSR引物、应用及构建方法有效
| 申请号： | 201910695116.4 | 申请日： | 2019-07-30 |
| 公开（公告）号： | CN110257551B | 公开（公告）日： | 2022-03-22 |
| 发明（设计）人： | 王力荣;关利平;朱更瑞;方伟超;王新卫;陈昌文;李勇 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院郑州果树研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 郑州中鼎万策专利代理事务所(普通合伙) 41179 | 代理人： | 林新园 |
| 地址： | 450004 河南*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | 本发明公开了一套用于构建桃DNA指纹图谱的SSR引物、应用及构建方法，所述SSR引物由10对引物组成，包括如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.20所示的核苷酸序列。本发明通过对6份亲缘关系较远的种质为试材进行高深度重测序，对桃全基因组水平上的SSR位点进行检测，鉴定出141895个SSR标记位点。利用生物信息学手段分析了桃全基因组SSR位点在6份种质上的分布和多态性，获得187对多态性SSR位点。对187个位点设计出164对SSR引物，利用21个代表性品种为试材，对初始引物进行PCR扩增，从中获得10对多态性高、稳定性强、分辨率高、重复性好，非特异扩增片段少的核心引物。用10对核心引物对200份种质进行扩增，获得它们的基因型数据，区分率达到100％。 | ||
| 搜索关键词： | 一套 用于 构建 dna 指纹 图谱 ssr 引物 应用 方法 | ||
【主权项】：
1.一套用于构建桃DNA指纹图谱的SSR引物，其特征在于，由10对引物组成：引物SSR73由如SEQ ID NO.1所示的上游引物和如SEQ ID NO.2所示的下游引物组成；引物SSR93由如SEQ ID NO.3所示的上游引物和如SEQ ID NO.4所示的下游引物组成；引物SSR96由如SEQ ID NO.5所示的上游引物和如SEQ ID NO.6所示的下游引物组成；引物SSR107由如SEQ ID NO.7所示的上游引物和如SEQ ID NO.8所示的下游引物组成；引物SSR125由如SEQ ID NO.9所示的上游引物和如SEQ ID NO.10所示的下游引物组成；引物SSR152由如SEQ ID NO.11所示的上游引物和如SEQ ID NO.12所示的下游引物组成；引物SSR169由如SEQ ID NO.13所示的上游引物和如SEQ ID NO.14所示的下游引物组成；引物SSR179由如SEQ ID NO.15所示的上游引物和如SEQ ID NO.16所示的下游引物组成；引物SSR181由如SEQ ID NO.17所示的上游引物和如SEQ ID NO.18所示的下游引物组成；引物SSR184由如SEQ ID NO.19所示的上游引物和如SEQ ID NO.20所示的下游引物组成。
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