[发明专利]一种用于FFPE样本DNA质控的试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201910781846.6 | 申请日: | 2019-08-23 |
公开(公告)号: | CN110564833A | 公开(公告)日: | 2019-12-13 |
发明(设计)人: | 任绪义;张锋;曹子豪;毕亭亭 | 申请(专利权)人: | 杭州迪安医学检验中心有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6876 | 分类号: | C12Q1/6876;C12Q1/6851 |
代理公司: | 11427 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 陈娟 |
地址: | 310030 浙江省杭*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种用于FFPE样本DNA质控的试剂盒及检测方法,属于生物检测技术领域。本试剂盒中包含的引物和探针序列如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4所示,实施步骤包括:采用生物信息学技术手段在人类基因组序列上(hg19)设计了3条PCR扩增引物,通过三条引物采用荧光定量PCR技术对待评估标本进行PCR扩增(包含108bp和212bp的扩增产物),根据两个扩增产物的CT值差异以及浓度,对标本质量进行评估,为PCR扩增或第二代测序(NGS)等下游分子实验提供重要的样本质量依据。 | ||
搜索关键词: | 扩增产物 试剂盒 引物 人类基因组序列 生物信息学技术 生物检测技术 荧光定量PCR 探针序列 下游分子 样本DNA 标本 评估 测序 质控 样本 检测 | ||
【主权项】:
1.一种用于FFPE样本中DNA质控的试剂盒,其特征在于,该检测试剂盒包括用于扩增的试剂包括以下3条引物和1条探针,其中3条引物分别为:/nSEQ ID NO.:1:CCAAGAGGTAGAGATCATCAAGAGC;/nSEQ ID NO.:2:TCCATTAGACCAGAAAAGACAGCA;/nSEQ ID NO.:3:CCAAGAATCAAGACAGACACAAA;/n1条探针为:SEQ ID NO.:4:FAM-TTGATGGGACGTATT-MGB;/n其中SEQ ID NO.:1与SEQ ID NO.:2引物得到扩增子1,以及SEQ ID NO.:1与SEQ IDNO.:3引物对得到扩增子2,扩增子1长度为108bp,扩增子2长度为212bp,并且扩增1和扩增子2在人类基因组(hg19)上存在多个拷贝,且分布于不同的染色体上。/n
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