[发明专利]一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型、构建方法及应用有效

专利信息
申请号: 201910786373.9 申请日: 2019-08-24
公开(公告)号: CN110501414B 公开(公告)日: 2022-03-11
发明(设计)人: 李进;鲁卫平;胡韦维;黎敏;黄庆;邓少丽 申请(专利权)人: 中国人民解放军陆军特色医学中心
主分类号: G01N27/62 分类号: G01N27/62;G06K9/62
代理公司: 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 代理人: 杨柳岸
地址: 400042 重*** 国省代码: 重庆;50
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摘要: 发明涉及一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型、构建方法及应用,通过MALDI‑TOF MS对VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的质谱蛋白特征峰进行分析,建立区分两种亚型的识别模型;通过该识别模型可快速准确地鉴别VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌,具有操作简便,耗时短等优点,因此,这为MALDI‑TOF MS鉴定细菌亚型的研究提供了全新的思路,具备非常广的应用前景。
搜索关键词: 一种 vim spm 金属 铜绿 假单胞菌 识别 模型 构建 方法 应用
【主权项】:
1.一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型的构建方法,其特征在于,具体步骤如下:/n(1)首先将VIM型和SPM型菌株质谱结果导入SARAMIS数据库,通过对两者质谱峰进行聚类分析,发现两者之间存在部分有差异的质谱峰;然后通过LaunchPad软件将两者质谱峰进行比较分析,得到17个高信号强度峰作为两者的共有质量峰;/n(2)为筛选VIM型和SPM型菌株之间有差异的特征峰,再次利用LaunchPad软件分别比较VIM型菌株和非VIM型以及SPM型菌株和非SPM型的质谱特征峰;/n(3)最后选取VIM型菌株的4个特征峰和非VIM型菌株的3个特征峰作为鉴定VIM型的模型,选取SPM型菌株的2个特征峰和非SPM型菌株的2个特征峰作为鉴定SPM型的模型。/n
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