[发明专利]一种基于测序数据进行SSR分型的方法及系统有效
| 申请号： | 201910827702.X | 申请日： | 2019-09-03 |
| 公开（公告）号： | CN110570901B | 公开（公告）日： | 2022-03-18 |
| 发明（设计）人： | 王凤格;霍永学;许理文;刘文彬;张云龙 | 申请（专利权）人： | 北京市农林科学院 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 马瑞 |
| 地址： | 100097 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明实施例提供一种基于测序数据进行SSR分型的方法及系统。该方法包括：获取待检测的基因序列，及所述基因序列每个检测位点的参考序列，生成配置文件；将测序得到的测序序列回贴至所述参考序列上，使得所述配置文件转换成按照位点排序的预设格式文件；对所述预设格式文件按照所述每个检测位点进行拆分，提取所述每个检测位点的测序片段以及所述测序片段对应的比对信息，基于所述测序片段和所述比对信息得到每一条序列对应的SSR分型。本发明实施例通过基于测序数据实现待检测基因序列的SSR分型，实现了快速对多位点、多样品的高通量测序检测，很好地兼容各物种的SSR分型需求，可自定义输出文件格式，大大提高了分型效率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 序数 进行 ssr 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种基于测序数据进行SSR分型的方法，其特征在于，包括：/n获取待检测的基因序列，及所述基因序列每个检测位点的参考序列，生成配置文件；/n将测序得到的测序序列回贴至所述参考序列上，使得所述配置文件转换成按照位点排序的预设格式文件；/n对所述预设格式文件按照所述每个检测位点进行拆分，提取所述每个检测位点的测序片段以及所述测序片段对应的比对信息，基于所述测序片段和所述比对信息得到每一条序列对应的SSR分型。/n
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