[发明专利]基于高通量测序的褐菖鲉SNP检测方法有效
申请号: | 201910875041.8 | 申请日: | 2019-09-17 |
公开(公告)号: | CN110551806B | 公开(公告)日: | 2023-05-02 |
发明(设计)人: | 蔡珊珊;徐胜勇;高天翔 | 申请(专利权)人: | 浙江海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;G06F18/23;G16B20/20 |
代理公司: | 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 | 代理人: | 吴秉中 |
地址: | 316100 浙江省舟山市普陀区*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明提供一种基于高通量测序的褐菖鲉SNP检测方法,属于基因工程技术领域,包括如下步骤:提取褐菖鲉基因组DNA;将基因组DNA酶切,酶切液中加入Adapter接头进行接头连接;将接头连接获得的不同样品DNA片段混合,进行PCR扩增,然后将产物进行测序;将测序得到的原始数据分选聚类,按样品个体进行数据质控并删除Adapter接头序列,将序列比对到参考基因组上,提取SNP位点,筛选用于群体遗传结构分析的SNP位点。本发明SNP检测方法能够减少DNA降解且提高DNA纯度,技术稳定、重复性高、能够在降低成本的情况下大量开发基因组分子标记,该检测方法。 | ||
搜索关键词: | 基于 通量 褐菖鲉 snp 检测 方法 | ||
【主权项】:
1.基于高通量测序的褐菖鲉SNP检测方法,其特征在于:包括如下步骤:/n提取褐菖鲉基因组DNA;/n将所述基因组DNA酶切,酶切液中加入Adapter接头进行接头连接;/n将所述接头连接获得的不同样品DNA片段混合,进行PCR扩增,然后将产物进行测序;/n将测序得到的原始数据分选聚类,按样品个体进行数据质控并删除Adapter接头序列,将序列比对到参考基因组上,提取SNP位点,筛选用于群体遗传结构分析的SNP位点。/n
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