[发明专利]一种叶绿体DNA的富集方法在审
申请号: | 201910876698.6 | 申请日: | 2019-09-17 |
公开(公告)号: | CN110734907A | 公开(公告)日: | 2020-01-31 |
发明(设计)人: | 林芹;龙欢;袁方;陶晔;曾亮;林爱婷 | 申请(专利权)人: | 上海凌恩生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 31260 上海晨皓知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 成丽杰 |
地址: | 201800 上海市嘉*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明属于分子生物学技术领域,特别涉及一种叶绿体DNA的富集方法。本发明的方法基于植物细胞中的叶绿体DNA与细胞核DNA甲基化位点存在的差异,利用带有蛋白A修饰的磁珠,通过MBD2‑Fc蛋白媒介,将植物基因组DNA中的细胞核DNA和叶绿体DNA进行分离,并进一步实现对叶绿体DNA的富集。利用本发明的方法,在测序前进行叶绿体DNA的富集,然后对富集后的叶绿体DNA进行测序,可有效提高测序数据中叶绿体DNA序列的比例,显著提高测序的准确度、降低测序成本。 | ||
搜索关键词: | 叶绿体DNA 测序 富集 细胞核DNA 分子生物学技术 植物基因组DNA 甲基化位点 测序数据 植物细胞 准确度 蛋白A 磁珠 修饰 媒介 | ||
【主权项】:
1.一种叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,包括:/n(1)提取植物基因组DNA;/n(2)使蛋白A修饰的磁珠与MBD2-Fc蛋白结合,得到处理后的磁珠;/n(3)将所述植物基因组DNA加入所述处理后的磁珠中,混匀,对混合物进行室温下孵育;/n(4)对孵育后的混合物离心,于磁力架上静置,细胞核DNA通过与磁珠上的MBD2-Fc蛋白结合而附着到磁珠上,叶绿体DNA保留在上清液中,取上清液;/n(5)使用磁珠对所述上清液中的叶绿体DNA进行回收,即得到富集后的叶绿体DNA。/n
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