[发明专利]基于高通量测序的蕨麻根际微生物多样性及菌群解析方法在审
| 申请号： | 201911156398.7 | 申请日： | 2019-11-22 |
| 公开（公告）号： | CN110669835A | 公开（公告）日： | 2020-01-10 |
| 发明（设计）人： | 王雅琼;李军乔;白世俊;韦梅琴 | 申请（专利权）人： | 青海民族大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 51229 成都正华专利代理事务所(普通合伙) | 代理人： | 李蕊 |
| 地址： | 810007 青*** | 国省代码： | 青海;63 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于高通量测序的蕨麻根际微生物多样性及菌群解析方法，包括以下步骤：S1.采集高原蕨麻在根区外土壤及根际土壤；S2.从各样品土壤中提取微生物总DNA，PCR扩增上述总DNA中16SrDNA；S3.对扩增产物质量鉴定，并将不同样品PCR扩增产物按等质量进行混合；S4.对混合文库进行片段大小和定量检测，并高通量测序；S5.准确测定各样品土壤微生物群落组成，进行生物信息学分析。本发明解析方法能解析高原蕨麻根际微生物群落的多样性特征。 | ||
| 搜索关键词： | 蕨麻 解析 高通量测序 根际微生物 样品土壤 生物信息学分析 微生物群落组成 微生物总DNA 多样性特征 定量检测 根际土壤 混合文库 扩增产物 质量鉴定 总DNA 高原 菌群 多样性 采集 土壤 | ||
【主权项】：
1.一种基于高通量测序的蕨麻根际微生物多样性及菌群解析方法，其特征在于，包括以下步骤：/nS1.采集高原蕨麻在根区外土壤及根际土壤；/nS2.分别从两种样品土壤中提取微生物总DNA，然后PCR扩增DNA中16SrDNA；/nS3.对扩增产物质量鉴定，并将不同样品PCR扩增产物按等质量进行混合；/nS4.对混合文库进行片段大小和定量检测，并高通量测序；/nS5.准确测定各样品土壤微生物群落组成，进行生物信息学分析：/n(1)分别收集根区外土壤及根际土壤的生物信息数据；/n(2)对比根区外土壤及根际土壤中的菌种所属类群：/n菌种属于相同类群：根区外土壤中提取的微生物基因序列所属的微生物类群占根区外土壤中提取的微生物基因序列所属的微生物总类群的比例为X
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