[发明专利]全基因组甲基化非重亚硫酸氢盐测序文库及构建在审

专利信息
申请号: 201911159400.6 申请日: 2019-11-22
公开(公告)号: CN110820050A 公开(公告)日: 2020-02-21
发明(设计)人: 张燕艳;杨玲;管彦芳;姬利延;贾明玺;张珍 申请(专利权)人: 北京吉因加科技有限公司;苏州吉因加生物医学工程有限公司
主分类号: C40B40/06 分类号: C40B40/06;C40B50/06;C12Q1/6858
代理公司: 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 代理人: 谢楠
地址: 102200 北京市昌平区中关村科技园区昌平园*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明涉及生物信息学技术领域,具体涉及一种全基因组甲基化非重亚硫酸氢盐的测序文库及构建、用途,包括TET酶反应液,所述TET酶反应液包括如下独立包装的组分:TET酶氧化缓冲液;所述TET酶氧化缓冲液包括如下微摩尔份的组分:HEPES或Tris–Cl(20‑167)×103份,NaCl(100‑333)×103份,α‑KG或2‑oxoglutarate 3.3×103份,抗坏血酸6.67×103份,和三磷酸腺苷4×103份;采用上述试剂盒结合Fe(NH4)2(SO4)2以及TET酶可以将5mc氧化为5cac,5cac在还原剂作用下被还原为二氢尿嘧啶,经PCR测序识别为T,实现在非重亚硫酸氢盐条件下的DNA甲基化“C”到“T”转化,解决现有的基于亚硫酸氢盐转化构建的甲基化测序文库存在的碱基不平衡,测序数据使用率低的缺陷,该配方还具有组分精简,TET酶使用量极低,显著降低成本的效果。
搜索关键词: 基因组 甲基化 亚硫酸 氢盐测 序文 构建
【主权项】:
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