[发明专利]香樟叶绿体SNP分子标记的多态性引物及其应用有效
申请号: | 201911216302.1 | 申请日: | 2019-12-02 |
公开(公告)号: | CN110760610B | 公开(公告)日: | 2020-10-30 |
发明(设计)人: | 杨茂霞;胥猛;钟永达;郦芝汀 | 申请(专利权)人: | 南京林业大学;江西省科学院生物资源研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 南京申云知识产权代理事务所(普通合伙) 32274 | 代理人: | 邱兴天 |
地址: | 210037 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了樟叶绿体SNP分子标记的多态性引物及其应用,属于林业分子生物学技术领域。本发明筛选了11对香樟叶绿体SNP分子标记的多态性引物,将其应用在古樟遗传多样性分析和古樟谱系分析中,基于叶绿体单倍型分析显示,不同单倍型分布差异明显,大部分单倍型只存在于特定的群体中,只有少数单倍型为共享单倍型,表明单倍型间存在一定的地理分化。18个古樟群体的遗传分化系数Fst为0.212,基因流Nm为0.929,表明古樟群体间存在中等的基因流。本发明的SNP分子标记重复性好,能够全面揭示香樟遗传多样性真实水平,为野生香樟资源保护利用提供理论依据。 | ||
搜索关键词: | 香樟 叶绿体 snp 分子 标记 多态性 引物 及其 应用 | ||
【主权项】:
1.香樟叶绿体SNP分子标记的多态性引物,其特征在于,包括11对多态性引物,其引物核苷酸序列如下:/nCpSNP1上游引物如SEQ ID NO.1所示;/nCpSNP1下游引物如SEQ ID NO.2所示;/nCpSNP2上游引物如SEQ ID NO.3所示;/nCpSNP2下游引物如SEQ ID NO.4所示;/nCpSNP9上游引物如SEQ ID NO.5所示;/nCpSNP9下游引物如SEQ ID NO.6所示;/nCpSNP13上游引物如SEQ ID NO.7所示;/nCpSNP13下游引物如SEQ ID NO.8所示;/nCpSNP14上游引物如SEQ ID NO.9所示;/nCpSNP14下游引物如SEQ ID NO.10所示;/nCpSNP15上游引物如SEQ ID NO.11所示;/nCpSNP15下游引物如SEQ ID NO.12所示;/nCpSNP16上游引物如SEQ ID NO.13所示;/nCpSNP16下游引物如SEQ ID NO.14所示;/nCpSNP18上游引物如SEQ ID NO.15所示;/nCpSNP18下游引物如SEQ ID NO.16所示;/nCpSNP19上游引物如SEQ ID NO.17所示;/nCpSNP19下游引物如SEQ ID NO.18所示;/nCpSNP20上游引物如SEQ ID NO.19所示;/nCpSNP20下游引物如SEQ ID NO.20所示;/nCpSNP21上游引物如SEQ ID NO.21所示;/nCpSNP21下游引物如SEQ ID NO.22所示。/n
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