[发明专利]一种结直肠癌预后显著相关ceRNA调控网络的构建方法有效
| 申请号： | 201911290283.7 | 申请日： | 2019-12-16 |
| 公开（公告）号： | CN111128299B | 公开（公告）日： | 2022-08-30 |
| 发明（设计）人： | 郭丽;杨国伟;康一浩;李孙静 | 申请（专利权）人： | 南京邮电大学 |
| 主分类号： | G16B20/50 | 分类号： | G16B20/50;G16B30/00 |
| 代理公司： | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人： | 刘艳艳 |
| 地址： | 210046 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种结直肠癌预后显著相关ceRNA调控网络的构建方法，基于高通量测序数据通过生物信息学整合分析筛选得到，包括：对收集的4个结直肠癌基因表达数据集进行差异基因表达分析，筛选共有的差异表达基因；通过String和Cytoscape软件，构建蛋白质‑蛋白质相互作用网络，结合相应基因的生存分析筛选得到关键基因，根据关键基因对上游miRNA进行预测分析，对上游miRNA进行结直肠癌病人生存分析，筛选出与预后显著相关的miRNA。基于miRNA进行相互作用的lncRNA筛选分析，筛选出与预后显著相关的lncRNA。将得到的关键基因（hub gene），miRNA，lncRNA通过其相互作用关系构建ceRNA网络，并根据lncRNA,miRNA和hub gene在COAD中的表达趋势进行评估，得到与COAD预后显著相关的ceRNA调控网络。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 直肠癌 预后 显著 相关 cerna 调控 网络 构建 方法 | ||
【主权项】：
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