[发明专利]一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用在审

专利信息
申请号: 202010181207.9 申请日: 2020-03-16
公开(公告)号: CN111440869A 公开(公告)日: 2020-07-24
发明(设计)人: 张红雨;全源;佟馨宇;李姜;黄清 申请(专利权)人: 武汉百药联科科技有限公司;华中农业大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11;G16B20/20;G16B40/20
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 颜希文
地址: 430070 湖北省*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明公开了一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用。所述方法包括以下步骤:(1)对样本数据进行甲基化分析,获得与预测原发性乳腺癌发生风险相关的甲基化位点;(2)获得针对所述甲基化位点的甲基化Beta值;(3)基于所述甲基化位点的甲基化Beta值构建原发性乳腺癌发生风险预测模型,并通过计算比值比验证该模型的可行性;(4)采用机器学习方法构建基于所述甲基化位点的原发性乳腺癌发生风险预测模型,计算比值比、AUC、召回率、精确率和F1值,与步骤(3)的预测模型进行相互验证;(5)所述预测模型中甲基化探针对应的甲基化位点即为DNA甲基化标记物。本发明可提高原发性乳腺癌的检出率,适于大规模推广应用。
搜索关键词: 一种 用于 预测 原发性 乳腺癌 发生 风险 dna 甲基化 标记 及其 筛选 方法 应用
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